Valinta juurikanavan ja poiston välillä riippuu monista olosuhteista, mukaan lukien kohtuuhintaisuus, hammaslääkärin suositukset, hampaan näkyvyys, onnistumisprosentti, epämukavuustaso ja onnistumisprosentti. Molempia menettelyjä on myös harkittava ottaen huomioon, mitä muuta tarvitaan. Juurikanavia seuraa tyypillisesti posliini- tai metallikruunujen sijoittaminen, erityisesti aikuisilla. Poiston jälkeen potilaat voivat joko päättää olla tekemättä mitään tai saada hammasimplantin, johon liittyy useita leikkauksia.
Ehkä suurin tekijä valittaessa juurikanavan ja poiston välillä on potilaan taloudellinen tilanne. Jopa vakuutuksella potilaat voivat odottaa maksavansa paljon enemmän taskustaan juurikanavasta ja kruunusta kuin yksinkertainen poisto. Hammasimplanttien leikkaus on vielä kalliimpaa. Jotkut hammaslääkärit, suun kirurgit ja endodontologit voivat mahdollistaa potilaiden maksamisen ajan kuluessa, mutta monet haluavat kokonaismaksun etukäteen. Täten henkilön taloudellinen ja vakuutusasema joillakin alueilla voi rajoittaa voimakkaasti valintaa juurikanavan ja louhinnan välillä.
Kun potilaalla on varaa kalliimpaan toimenpiteeseen, se auttaa varmasti hammaslääkärin neuvojen saamisessa. Useimmat hammaslääkärit haluavat säästää olemassa olevan hampaan, ja juurikanava/kruunumenetelmä saavuttaa tämän tavoitteen. Muissa tapauksissa murtunut, kivulias ja/tai vaurioitunut hammas on saattanut jo juurruttaa ja täyttää tai olla kuoleva. Hampaan pelastaminen juurikanavan kautta ei ole aina mahdollista, ja poisto voisi olla parempi potilaan kivun vähentämiseksi tai koska se on paras vaihtoehto.
Jotkut punnitsevat taloutta ja punnitsevat myös hampaan näkyvyyttä päätöksenteossa. Jos hammas on suun etuosassa, jossa sen havaitaan puuttuvan, he päättävät mieluummin juurikanavan ja kruunun. On selvää, että uutto ilman vaihtoa tarkoittaa, että suussa on näkyvä rako. Toisaalta, jos valinta juurikanavan ja poiston välillä koskee hampaita suun takana, potilaat saattavat vain valita poiston yksin, koska ihmiset eivät todennäköisesti huomaa puuttuvaa hammasta.
On muitakin, jotka perustavat mielipiteensä juurikanavan/kruunun onnistumisprosenttiin verrattuna uuttoon/istutukseen. Juurikanavan ja kruunun reitin onnistumisprosentti on hieman suurempi. Myös poisto yksinään onnistuu, mutta hammasimplantit eivät ehkä kestä elinikää ja saattavat vaatia korvaamista.
Vaihtoehtoisesti valinta juurikanavan ja poiston välillä voi keskittyä epämukavuuteen, joka liittyy molempiin toimenpiteisiin. Ammattitaitoisen hammaslääkärin pitäisi pystyä saamaan potilaat mukavaksi kumpaankin toimenpiteeseen, ja jotkut hammaslääkärit tarjoavat jopa nukkuva hammashoitoa, jotta potilaiden ei tarvitse tuntea, mitä tapahtuu. Toipumisaika ja hammasimplanttien toimenpiteiden kesto ovat paljon merkittävämpiä kuin juurikanaviin ja kruunuihin liittyvät.