Kilpirauhassyövän uusiutuminen ei ole ennenkuulumatonta, mutta todelliset tilastot vaihtelevat suuresti syövän vaiheen ja sen hoidon mukaan. Potilailla, joilta kilpirauhanen on poistettu taudin aikaisemmassa vaiheessa, on vähemmän todennäköistä, että heillä on uusi tauti tämän tyyppisen syövän kanssa. Ne, joilla on vain osittainen poisto tai joilla on taudin myöhempi vaihe, kärsivät todennäköisemmin uusiutumisesta. Kaiken kaikkiaan kilpirauhassyövän viiden vuoden eloonjäämisaste on erittäin hyvä verrattuna muihin syöpätyyppeihin.
Kilpirauhassyövän uusiutumisaste on suhteellisen alhainen potilailla, joilla on varhainen vaiheen syöpä. Nämä hinnat ovat vielä alhaisempia niille, jotka saavat täydellisen kilpirauhasen poiston ja seurantahoidon. Kilpirauhassyövän varhaisimmat vaiheet rajoittuvat kilpirauhanen ja joskus sitä välittömästi ympäröiviin imusolmukkeisiin. Yleensä kilpirauhassyövän myöhempiä vaiheita on kuitenkin helpompi hoitaa kuin muita sairauden muotoja.
Yksi tekijä, joka voi vaikuttaa kilpirauhassyövän uusiutumiseen, on hoidon aggressiivisuus. Jos kaikki syöpä havaitaan ja tuhotaan, uusiutumisprosentti on erittäin alhainen. Useimmat kilpirauhassyövät havaitaan näissä aikaisemmissa vaiheissa, ja monet syövät leviävät hitaasti. Myöhemmin lavastettu syöpä on myös hyvin hoidettavissa, ja viiden vuoden eloonjäämisaste on 60% neljännen vaiheen syövissä.
On tapoja estää kilpirauhassyövän uusiutuminen potilailla, joilla on diagnosoitu tapaus. Hoito on aloitettava mahdollisimman pian ja syöpä on poistettava niin paljon kuin mahdollista. Jos syöpäsolut ovat levinneet kilpirauhasen ulkopuolelle, hoitoja, kuten kemoterapiaa ja sädehoitoa, voidaan tarvita niiden tuhoamiseksi. Potilaiden tulee myös käydä kaikissa suunnitelluissa tarkastuksissa testattavakseen kilpirauhasen alueen epätavallisten solujen varalta.
Niillä, jotka saavat hoitoa nopeasti, on alhaisin kilpirauhassyövän uusiutumisaste. Toisilla, joita hoidetaan myöhemmin tai joiden kilpirauhanen ei ole kokonaan poistettu, voi olla suurempi toistuvien syöpien määrä. Syövän uusiutuminen perustuu jokaiseen yksittäiseen henkilöön, mutta ei ole harvinaista, että syöpä palaa, joten varotoimia on noudatettava.