Yleensä hypoplastisen oikean sydämen oireyhtymän (HRHS) syy -tekijöitä ei voida tunnistaa. Lääketiede ei voi sitoa ehtoa geneettisiin mutaatioihin tai perintöön, vaikka on hyvin vähäinen riski saada useampi kuin yksi lapsi, jolla on HRHS. Riittämättömän foolihapon saaminen tai joidenkin lääkkeiden tai aineiden käyttö liittyy suurempaan sikiön sydänvaurioiden riskiin, mukaan lukien hypoplastinen oikean sydämen oireyhtymä. Joillakin monijärjestelmällisillä geneettisillä häiriöillä voi myös olla korkeampi HRHS-esiintyvyys.
Sikiön kehityksessä hypoplastinen oikean sydämen oireyhtymä esiintyy keuhkoventtiilin ja valtimon epäasianmukaisen kehityksen seurauksena. Kun nämä ovat alikehittyneitä, ne eivät salli asianmukaista veren kiertoa sydämen oikean puolen läpi. Tätä verenkiertoa tarvitaan sydämen rakenteiden kypsymiseen.
Tuloksena on alamittainen oikea kammio ja liian pienet trikuspidaaliventtiili ja eteinen. Vaikka sikiö on vielä kohdussa, se saa happea äidiltä, ja tämä vika on usein selviytyvä. Vakavia ongelmia esiintyy syntymän jälkeen, koska sydän ei pysty tukemaan verenkiertoa keuhkoihin ja kehosta tulee nopeasti happea.
HRHS ei ole tällä hetkellä parannettavissa, vaikka vaiheittainen leikkaussarja tai sydänsiirto ovat vaihtoehtoja. Selviytymistä pitkälle aikuisuuteen odotetaan nyt monille vauvoille, joilla on tämä tila, mutta todellisia sydämen vikoja ei voida korjata. Lisää tutkimusta kirurgisesta korjauksesta on perusteltua, mutta myös hypoplastisen oikean sydämen oireyhtymän syiden ymmärtäminen olisi hyödyllistä.
Tällä hetkellä ei ole johdonmukaisesti tunnistettu joukkoa geenejä, jotka vaikuttavat keuhkoventtiiliin ja sikiön oikean sydämen kehitykseen. Jotkut olosuhteet, joilla on geneettinen perusta ajoittain, mutta eivät aina, tuottavat HRHS: ää. Näitä ovat Ivemarkin oireyhtymä, johon liittyy pernan häiriöitä, dekstrokardiaa ja erilaisia oikeanpuoleisia vikoja. Downin oireyhtymä liittyy sydämen vajaatoimintaan ja voi aiheuttaa hypoplastista oikean sydämen oireyhtymää joillakin, mutta ei kaikilla yksilöillä.
Useiden lääkkeiden ja aineiden on todettu mahdollisesti aiheuttavan hypoplastista oikean sydämen oireyhtymää ja muita sydänvikoja. Monet valituista serotoniinin takaisinoton estäjistä ja serotoniinin norepinefriinin takaisinoton estäjistä on luotettavasti yhdistetty lisääntyneisiin sydämen vajaatoimiin lapsilla. Mielialan stabilointiaineilla, kuten valproiinihapolla, karbamatsepiinilla ja litiumilla, on samanlaisia riskejä. Kokaiini ja amfetamiinit näyttävät myös aiheuttavan sydämen vajaatoimintaa ja muita synnynnäisiä vikoja.
Sopivan foolihappotason puute on yhdistetty moniin synnynnäisiin epämuodostumiin jo jonkin aikaa. Nyt näyttää siltä, että riittämättömät tasot voivat tehdä todennäköisemmäksi sellaisten tilojen esiintymisen, kuten hypoplastinen oikean sydämen oireyhtymä tai muut sydänviat. Ihannetapauksessa foolihapon käyttö tulisi aloittaa ennen raskautta tämän riskin vähentämiseksi.
Vanhemmat, joilla on lapsia, joilla on HRHS, ovat usein huolestuneita, koska näille vakaville ja vaarallisille vikoille ei ole selitystä. Äiti voi tehdä “kaiken oikein” ja silti saada lapsen, jolla on hypoplastinen oikean sydämen oireyhtymä. Vaikka eloonjäämisasteiden nousu rohkaisee perheitä, he voivat olla lannistuneita siitä, että tutkijat eivät pysty luotettavasti tunnistamaan selvää syytä.