Ehkä yleisin syy niskajäykkyyteen ja päänsärkyyn on niskan ja hartioiden lihasten liiallinen käyttö. Kireiden lihasten aiheuttama jännitys voi aiheuttaa jännityspäänsärkyä, joka voi kestää useita tunteja tai jopa päivän tai enemmän, jos sitä ei käsitellä. Stressin aiheuttama kireys niskassa ja hartioissa voi myös aiheuttaa jäykkää niskaa ja päänsärkyä, samoin kuin huono asento tai ylävartalon ja selän lihasten huono kunto. Sairaudet, kuten flunssa, flunssa tai poskiontelotulehdukset, voivat myös aiheuttaa jäykkää niskaa ja päänsärkyä.
Vammoja esiintyy usein niskassa ja hartioissa, erityisesti urheilijoiden tai aktiivisten ihmisten keskuudessa. Lihaskudoksia esiintyy, kun pienet kuidut, jotka muodostavat lihaksen, alkavat repeytyä, mikä aiheuttaa kireyttä ja kipua. Tämä kireys voi aiheuttaa niskajäykkyyttä ja päänsärkyä, jos tällainen vamma ilmenee niskassa, hartioissa tai yläselässä, ja se on erityisen todennäköistä pian loukkaantumisen jälkeen. Loukkaantuneen lihaksen hoidon pitäisi auttaa lievittämään niskajäykkyyttä ja päänsärkyä, mutta joissakin tapauksissa kipulääkkeet saattavat olla tarpeen kipujen tylsistymiseksi. Vaurioituneen alueen jäätäminen ja lepääminen useita tunteja tai jopa päiviä auttaa parantamaan vamman nopeasti.
Huonosti hoidetut niskan ja hartioiden lihakset väsyvät ja kireät, mikä johtaa jäykkään niskaan ja päänsärkyyn. Tämän välttämiseksi on tärkeää vahvistaa ja sävyttää näitä lihaksia säännöllisesti, koska vahvemmat lihakset väsyvät vähemmän ja kiristyvät. Säännöllinen harjoitusrutiini, vaikkakin minimaalinen, auttaa lievittämään säännöllistä kipua niskassa ja päässä. On myös syytä tutkia myös päivittäisiä rutiineja, koska huono asento voi aiheuttaa jännitystä niskaan ja hartioihin, mikä voi puolestaan johtaa jäykään kaulan ja päänsärkyyn. Jos tämä on ongelma, kannattaa harkita ergonomisen tuolin ostamista, joka tukee selkää ja kaulaa.
Sairaudet aiheuttavat usein niskajäykkyyttä ja päänsärkyä eri syistä. Flunssasta kärsivät ihmiset valittavat usein näistä oireista ja muista epämiellyttävistä oireista. Yleinen kylmä voi myös aiheuttaa tällaista kipua, ja poskiontelotulehdukset ja allergiat voivat aiheuttaa päänsärkyä ja niskajäykkyyttä, varsinkin jos sairastava yskää ja aivastaa säännöllisesti. Pään ja kaulan rasitus sekä tällaisiin sairauksiin liittyvät ruuhkat voivat aiheuttaa epämukavuutta pään ja kaulan alueella. Kipulääkkeet ja muut kylmälääkkeet auttavat usein poistamaan tällaisen epämukavuuden.