Kipu istuessa voi johtua monista sairauksista, kuten iskias, niveltulehdus, levyn tyrä, huono asento, myofaskiaalinen kipu -oireyhtymä, vammat vammoista ja jopa yksinkertaisesti väsyneet lihakset. Ihmiset, jotka istuvat pitkään, ovat erityisen alttiita kipulle istuessaan; ihmiset, jotka työskentelevät työpöydän ääressä koko päivän, tai ihmiset, jotka ovat vain pyörätuolissa, kokevat todennäköisesti kipua istuessaan jossain vaiheessa. Kivun voimakkuus voi olla syy lääkärikäyntiin, vaikka useimmissa tapauksissa päivittäisten rutiinien ja istumistottumusten muutokset riittävät korjaamaan ongelman.
Myofaskiaalinen kipu -oireyhtymä on tila, jossa tietyt kehon alueet kokevat kipua. Kipu voi olla voimakasta ja se johtuu yleensä liipaisupisteestä tai kipuun johtavasta kehon osasta. Solmitut lihakset ovat yleensä syy kipuihin istuessaan tässä tapauksessa, ja käynti lääkärissä voi auttaa sairasta laatimaan suunnitelman tilan torjumiseksi. Tätä ehtoa ei edelleenkään ymmärretä kovin hyvin edes ammattilaiset, joten hoitovaihtoehdot vaihtelevat ja tulokset vaihtelevat riippuen potilaan reaktiosta hoitoihin.
Iskias syntyy, kun iskiashermo, joka kulkee alaselkästä alaspäin ja alaspäin kummankin jalan takana, puristuu jostain syystä, mikä johtaa usein kipeisiin, teräviin kipuihin, tunnottomuuteen tai pistelyyn missä tahansa jalkojen, pakaran, lonkan ja alaselän. Tämä on yleinen kipu istuessa, ja se voi johtua kireistä tai tulehtuneista lihaksista ja jänteistä tai selkärangan herniated levystä. Herniated levy esiintyy, kun kahden nikaman välissä oleva selkälevy pullistuu ja painaa siten selkärangan lähellä olevia hermoja vasten. Selkälevy voi puristaa istuinhermon, mikä aiheuttaa kipua istuessaan.
Huono ryhti on hyvin yleinen kipua aiheuttava tekijä istuessa, etenkin toimistotyöntekijöiden keskuudessa. Jos tuoli ei tue riittävästi alaselkää, selkää tukevat lihakset voivat väsyä, mikä johtaa näiden lihasten jännitykseen. Mitä tiukemmat lihakset ovat, sitä enemmän tuntuu epämukavalta; nämä kireät lihakset voivat alkaa vetää selkärankaa, lantiota ja muita luita ja niveliä, mikä johtaa luonnotonliikkeisiin kehossa. Nouseminen tuolilta säännöllisesti ja venyttely voi auttaa estämään kipua ja lisäämään verenkiertoa, ja ergonomisen tuolin käyttö voi lisätä alaselän, kaulan ja hartioiden tukea.