Monet sairaudet ja sairaudet voivat johtaa väliaikaiseen muistin menetykseen. Yleisimpiä pidetään epilepsiana, aivokasvaimina ja aivohalvauksina. Huumeiden ja alkoholin väärinkäyttö ja tietyntyyppiset päävammat, kuten aivotärähdykset, voivat myös aiheuttaa tilapäistä muistinmenetystä. Amnesiaa, joka on yleinen termi kaikentyyppiselle muistin menetykselle, hoidetaan tyypillisesti hoidolla lääkkeiden sijasta ja se on yleensä yleisempi vanhuksilla.
Epilepsiaa sairastavien väliaikaisen muistin menetyksen uskotaan johtuvan aivovaurioista, jotka johtuvat itse kouristuksista. Kohtauksen jälkeen hänellä ei yleensä ole muistia kohtaukseen johtaneista tapahtumista. Muistin menetys kestää yleensä vain muutaman tunnin, mutta voi joskus kestää päiviä tai viikkoja. Epileptisten tapahtumien esiintymistiheys voi myös vaikuttaa muistin menetyksen kestoon ja vakavuuteen. Ei ole olemassa hoitoa, jonka katsotaan olevan tehokas epilepsian muistinmenetykseen, mutta ihmiset, joilla on epilepsia, käyttävät tyypillisesti lääkkeitä kouristusten vähentämiseksi.
Alkoholin väärinkäyttö voi heikentää aivojen kykyä tuottaa uusia soluja, kun taas jotkut lääkkeet, kuten marihuana, voivat vaikuttaa suoraan hippokampukseen, aivojen osaan, jonka uskotaan käsittelevän muistia. Tutkimukset, joissa käsitellään marihuanan vaikutuksia muistiin, näyttävät tarjoavan ristiriitaisia tuloksia. Jotkut tutkimukset osoittavat, että muutaman kuukauden marihuanan käytöllä voi olla elinikäisiä vaikutuksia muistiin, kun taas toiset tutkimukset osoittavat, että vaikutukset vähenevät tai häviävät kokonaan vain muutaman viikon kuluttua.
Väliaikainen muistinmenetys on monien reseptilääkkeiden yleinen sivuvaikutus. Jotkut tutkimukset osoittavat, että yli 100 erilaista yleisesti määrättyä lääkettä voi aiheuttaa jonkinlaisen muistinmenetyksen. Masennuslääkkeet ja barbituraatit liittyvät muistin heikkenemiseen, samoin kuin jotkut antihistamiinit ja sydänlääkkeet. Lisäksi unettomuuden ja kivun hoitoon tarkoitetut lääkkeet voivat vaikuttaa muistiin.
Vanhusten katsotaan olevan suurempi riski tilapäiseen muistin menetykseen. Aivohalvaukset ovat yleisempiä vanhuksilla, samoin kuin dementiaa aiheuttavat sairaudet. Alzheimerin tauti on etenevä sairaus, joka yleensä johtaa täydelliseen muistin menetykseen, mutta varhaisessa vaiheessa näin ei aina ole. Potilaat voivat kärsiä vain lievästä tai tilapäisestä muistin heikkenemisestä monien vuosien ajan. Tämä sairaus, vaikka siitä tehdään paljon lääketieteellistä tutkimusta, ei ole täysin ymmärretty.
Lääkehoitoa ei yleensä pidetä tehokkaana väliaikaisen muistin menetyksen hoidossa. Toisaalta psykoterapia voi joskus auttaa, jos muistin menetys ei johdu vammasta tai sairaudesta. Jotkut psykologit ovat menestyneet käyttämällä menetelmiä, kuten hypnoosia, auttamaan potilaita palauttamaan kadonneet muistot.