16S rDNA on prokaryoottisen DNA: n osa, joka koodaa kaikissa bakteereissa esiintyvää geeniä. Bakteerit ovat prokaryoottisia, mikä tarkoittaa, että ne eivät sisällä solun ydintä tai organelleja, joten DNA kelluu vapaasti näissä yksisoluisissa organismeissa. 16S -rDNA -geeni koodaa RNA -juosetta, joka muodostaa osan ribosomista. Tätä RNA -juosetta kutsutaan ribosomaaliseksi RNA: ksi tai rRNA: ksi. 16S -rDNA: n r tarkoittaa myös ribosomaalia ja osoittaa, että tämä on geeni, joka koodaa osan ribosomista bakteerisolussa.
Ribosomit koostuvat kahdesta alayksiköstä, pienestä ja suuresta alayksiköstä. Kun kaksi alayksikköä yhdistyvät, lähetti -RNA (mRNA) syötetään läpi ja käännetään proteiinien muodostamiseksi. Bakteerisoluissa 16S rDNA -geenistä transkriptoitu rRNA muodostaa ribosomin pienen alayksikön. 23S rDNA- ja 5S -rDNA -geenit koodaavat rRNA: ta, joka muodostaa ribosomin suuren alayksikön.
On useita syitä, miksi 16S rDNA -geeniä pidetään hyödyllisenä. Ensimmäinen on se, että useimmat tutkijat käyttävät nyt DNA: ta organismien karakterisoimiseen fyysisten ominaisuuksien sijaan. Toiseksi tämä geeni löytyy vain bakteerisoluista, mikä tarkoittaa, että se on hyödyllinen tunnistettaessa, onko solu bakteeri vai peräisin kasvista, eläimestä tai sienestä. Lopuksi se on melko lyhyt verrattuna muihin bakteereista löydettyihin geeneihin, mikä tekee sekvensoinnista paljon helpompaa ja halvempaa.
16S rDNA -geeni on yksi kaikkein säilyneimmistä geeneistä. Tämä tarkoittaa, että se on muuttunut hyvin vähän ajan kuluessa tai vaihtelee hyvin vähän solusta toiseen. Jopa organismeilla, jotka ovat läheisesti sukua tai jotka ovat kehittyneet kauan sitten, on 16S rDNA -sekvenssit, jotka ovat hyvin samankaltaisia.
Tutkijat käyttävät tätä geeniä sekä muita ribosomaalisia geenejä mittaamaan taksonomiaa, fylogeniaa ja hajonta -astetta. Taksonomia on menetelmä organismien tieteelliseksi luokittelemiseksi samanlaisiin taksoneihin tai ryhmiin. Phylogeny tarkastelee organismien välisiä evoluutiosuhteita. Eroamisaste on menetelmä, jolla arvioidaan nopeus, jolla eri bakteerilajeja syntyi ja poikkesi esivanhemmistaan.
Mikro -organismeissa 16S -rDNA -geenin tutkimusta on käytetty tarkastamaan yksisoluisten organismien sukulaisuutta. Erityisesti kaikki geenivaihtelut havaitaan ja verrataan muihin bakteerisoluihin. Tutkimalla näitä eroja tutkijat voivat muodostaa evoluutiolinkkejä eri organismien välille.