Allergeeni on mikä tahansa antigeeni, joka aiheuttaa reaktion herkille yksilöille eikä ole loinen. Allergeeni voi olla melkein mitä tahansa, kunhan se aiheuttaa allergisen reaktion ihmisessä johonkin muuhun kuin loiseen. Yleensä vaste, joka tulee, kun allerginen henkilö joutuu kosketuksiin allergeenin kanssa, IgE -vaste, laukaistaan vain tuhoamaan kehoon tunkeutuneet loiset. Allergiat ovat seurausta siitä, että keho tunnistaa ei-loisen samanlaiseksi vaaraksi ja reagoi siihen samalla tavalla.
Viime kädessä kaikki voi olla allergeeni, eikä mikään ole aidosti universaalia allergeenia. Jotkut asiat nähdään yleisinä allergeeneina, kun taas toiset ovat suhteellisen harvinaisia. Samoin jotkut allergeeniin liittyvät asiat aiheuttavat hengenvaarallisen riskin henkilöille, joilla on korkea vaste, kun taas muut allergiat voivat olla yksinkertainen haitta. Ihmiset, joiden elimet tunnistavat esimerkiksi pölypunkkien erittymisen allergeeniksi, tuntevat yleensä vain kutinaa tai ehkä lievää ruuhkautumista. Joten vaikka pölypunkkien erittyminen on läsnä lähes kaikkialla, jopa ne ihmiset, jotka reagoivat siihen, eivät ole melkein koskaan vaarassa.
Toisaalta monet ihmiset, jotka ovat allergisia mehiläisten pistoille, voivat kokea anafylaksia, jos ne pistetään. Tämä voi tappaa heidät, jos heitä ei hoideta kovin nopeasti, mikä edellyttää, että nämä henkilöt kantavat mukanaan jonkinlaista epinefriiniä, pysäyttääkseen allergisen reaktion ennen kuin se pääsee käsistä. Joillakin ihmisillä on yhtä voimakkaita vastauksia tavallisiin elintarvikkeisiin ja ainesosiin, mikä tekee jalostetun ruoan syömisestä heille hankalan ehdotuksen.
Yhdysvaltain elintarvike- ja lääkevirasto tunnistaa kahdeksan yleistä ruokaa, jotka ovat allergeeneja, ja ne on merkittävä, jos niitä on tuotteissa tai jos tuote on käsitelty samalla koneella kuin ruoka, jossa on jokin näistä ainesosista. Nämä ainesosat ovat: vehnä, maito, maapähkinät, pähkinät, munat, soija, sulfiitit, äyriäiset ja kala. FDA valitsi nämä kahdeksan, koska suhteellisen suurella osalla väestöstä on jonkin verran allergisia reaktioita näille ainesosille.
Muita elintarvikkeita, joita ihmisten elimet voivat nähdä allergeenina, ovat pavut, maissi, kurpitsa ja selleri. Mehiläisten lisäksi monet ihmiset ovat allergisia myös ampiaisille tai hyttysille. Samoin monenlaiset homeet aiheuttavat allergisen reaktion ihmisissä, samoin kuin useiden tavallisten kasvien siitepölyt, mukaan lukien parrat, koivu, timotei-ruoho, poppeli ja nokkonen. Ja monet eläimistä saatavat sivutuotteet ovat allergeeni, erityisesti kissojen ja koirien hilse ja villa.
Joskus keho tunnistaa jopa lääkkeen, jonka on tarkoitus olla hyödyllinen allergeenina. Esimerkiksi monet ihmiset ovat allergisia penisilliinille, joten heidän on saatava vaihtoehtoinen hoito, muuten heidän kehonsa reagoi kielteisesti penisilliiniruiskeeseen. Koko sulfonamidiluokka, jota yleensä kutsutaan vain sulfa -lääkkeiksi, on toinen yleinen allergeeni. Koska näiden lääkkeiden ottamisen seuraukset, jos ne ovat allergeeneja, voivat olla tappavia, useimmat sairaalat ja lääkärit tarkistavat, ettei potilas ole allerginen tavallisille lääkkeille, ja yhä useammat lääkärit välttävät nämä yleiset allergeenit, jos on helppoa tee niin.