Bakteeriluokitus on prosessi, jossa bakteerityypit erotetaan toisistaan ja ryhmitellään niiden yhteisten ominaisuuksien mukaan. Tällainen luokittelu suoritetaan kansainvälisesti hyväksytyn biologisen taksonomian tai eliöiden luokittelutieteen puitteissa. Bakteeriluokittelussa otetaan huomioon useita asioita, erityisesti RNA -sekvenssit, mutta muun muassa muoto, biokemia ja ulkoisen kalvon ominaisuudet.
Vaikka organismien luokittelusta on erilaisia näkemyksiä, nykyinen järjestelmä jakaa kaiken elämän kolmeen osa -alueeseen. Bakteerit muodostavat yhden näistä alueista. Ne osoittavat äärimmäistä monimuotoisuutta ja muodostavat lukumääräisesti suuren enemmistön tunnetuista lajeista ja ovat massaltaan enemmän kuin kaikki maapallon monisoluiset organismit. Bakteerien luokittelu voi olla vaikeaa useista tekijöistä johtuen, etenkin kehittyneemmissä organismeissa esiintyvien monimutkaisten rakenteiden puuttumisesta sekä bakteerien taipumuksesta siirtää DNA -segmenttejä.
Bakteriologit käyttävät useita tekniikoita bakteerien luokittelussa. Muoto on yksinkertaisin tapa erottaa bakteerit toisistaan, ja näillä organismeilla voi olla erilaisia muotoja, kuten sauvoja, spiraaleja ja palloja. Muoto ei kuitenkaan välttämättä ole yksinomainen ominaisuus, ja bakteerit, jotka on ryhmitelty erilaisiin luokituksiin, voivat olla samanlaisia.
Muut morfologiset piirteet, kuten koko, voivat vaihdella merkittävästi lajeittain, ja tyypilliset ryhmittelyt voivat myös auttaa luokittelussa. Monet lajit muodostavat yleensä yksittäisten solujen ryhmiä, joiden lukumäärä voi vaihdella suuresti. Ulkoiset rakenteet, kuten pienet lonkeron kaltaiset rakenteet, joita kutsutaan flagellaksi, voivat myös auttaa erottamaan bakteerilajeja.
Toinen bakteeriluokituksen keskeinen työkalu on testi, joka tunnetaan nimellä gramma tahratesti, joka on nimetty 19 -luvun mikrobiologin mukaan. Tämä testi mittaa bakteerit niiden ulkokalvon paksuuden mukaan. Gram -negatiivisilla bakteereilla on hyvin ohut kalvo ja gram -positiivisilla bakteereilla on paksumpi kalvo.
Tekijät, kuten aineenvaihdunta ja muut biokemialliset erot, ovat toinen väline bakteerien luokittelussa. Bakteerit metaboloivat monenlaisia erilaisia yhdisteitä, ja tietty yhdiste tai yhdisteet, joita tietty bakteeri käyttää tai muuntaa, voivat auttaa sen tunnistamisessa ja luokittelussa. Muiden biokemiallisten tietojen analysointi voi myös auttaa tätä prosessia.
Molekyylianalyysitekniikoiden kehitys on mahdollistanut sen, että bakteriologit voivat erottaa bakteerit RNA -erojen ja spesifisten geenisekvenssien mukaan. Lisäanalyysi yksittäisten RNA- ja DNA -proteiinien kokonaismäärästä ja suhteista, joissa niitä on läsnä, tarjoaa toisen keinon luokitella. Käyttämällä joitakin tai kaikkia näitä tekniikoita ja havaittavia ominaisuuksia bakteriologit voivat luokitella bakteerit lajien mukaan ja ryhmitellä samanlaiset lajit yhteen.