Binaarinen yhdiste on aine, jonka molekyylit koostuvat kahden alkuaineen atomeista. Kunkin molekyylin yksittäisten atomien määrä voi vaihdella, mutta niiden on kuuluttava vain kahteen alkuaineeseen, vaikka alkuaineiden isotoopit ovat sallittuja. Binaariset yhdisteet ovat määritelmänsä mukaan joitakin yksinkertaisimmista yhdisteistä luonnossa, mutta ne ovat myös tärkeimpiä sekä orgaanisessa että epäorgaanisessa kemiassa. Ne luokitellaan laajalti joko ionisiksi tai kovalenttisiksi atomien välisten sidosten tyypin mukaan. Kemistit tunnustavat useita binaaristen yhdisteiden alaryhmiä ja osastoja luokittelua ja opetusta varten.
Aine, joka koostuu yhdestä metallista ja yhdestä epämetallielementistä, on ioninen binääriyhdiste. Nämä yhdisteet muodostuvat, kun positiivisesti varautuneet ionit sitoutuvat negatiivisesti varautuneisiin ioneihin. Näiden atomien muodostamat ionisidokset ovat erittäin vahvoja ja vaativat paljon energiaa hajotakseen. Useimmiten positiivisesti varautuneet ionit ovat metallin atomeja ja negatiivisesti varautuneet ionit tulevat epämetallista. Monet tämän tyyppiset yhdisteet ovat suoloja, kuten tavallinen ruokasuola, joka koostuu yhdestä natrium- ja yhdestä klooriatomista.
Toinen päätyyppi muodostuu kovalenttisilla sidoksilla sitoutuneiden atomien yhdistelmästä. Kovalenttiset kemialliset sidokset eivät ole yhtä vahvoja kuin ionisidokset, mikä tarkoittaa, että niiden katkaisemiseen tarvitaan suhteellisen vähän energiaa. Hiilivedyt, jotka koostuvat vain hiili- ja vetyatomeista, ovat yksi kovalenttisen binaarisen yhdisteen tyyppi. Vesi on ehkä tunnetuin. Tämä kovalenttinen yhdiste koostuu kahdesta vetyatomista ja yhdestä happiatomista.
Kemistit ovat kehittäneet järjestelmän kemikaalien ja muiden yhdisteiden nimeämiseksi, ja tämän järjestelmän tavan tunteminen voi auttaa tunnistamaan joitakin binaarisia yhdisteitä pelkästään niiden nimistä. Ionisten yhdisteiden nimet, jotka ovat yleensä epämetalliin sitoutunutta metallia, koostuvat yleensä metallin nimestä, jota seuraa epämetallielementin nimen lyhennetty muoto ja pääte “-ide”. Esimerkiksi suola on natriumkloridi, “-ide” auttaa tunnistamaan sen binääriseksi yhdisteeksi. Kovalenttiset yhdisteet noudattavat samanlaisia yleissopimuksia, ja kummankin tyyppisiä binaarisia yhdisteitä voi toinen termi muokata etuliitteellä merkitsemään yhden alkuaineen useita atomeja, kuten hiilidioksidia, jossa on kaksi happiatomia. Muita sääntöjä käytetään tietyissä muissa erityistapauksissa, ja joskus yhdiste ei ehkä noudata yleissopimuksia ollenkaan.