Endoskooppinen ablaatio on toimenpide, jossa kirurgi läpäisee katselualueen ja hoitovälineet pienten viiltojen kautta kehoon ja käyttää sähkövirtaa, jäädyttäviä kaasuja tai lämpöä tuhoamaan, irrottamaan ja hyytymään epänormaaleja kudoksia tai kasvaimia. Ablaation komplikaatioita ovat räjähdyksen tai tulipalon mahdollisuus toimenpiteen aikana, arpikudoksen muodostuminen ja tahaton kudoksen rei’itys.
Moninapainen elektrokauteri, joka tunnetaan myös nimellä MPEC, on yksi ablaatiotyyppi, jota kirurgit käyttävät kudoksen poistamiseen. Kirurgi kulkee katetrin endoskooppisen putken läpi kehoon. Katetrin päässä on kaksi pientä elektrodia, jotka syöttävät virran ja muodostavat täydellisen piirin. Kirurgi pystyy myös ruiskuttamaan kastelunesteitä paikkaan. Suoraan kosketukseen ja kevyeen paineeseen kohdistuva määrä virtaa kulkee kudokseen, joka palaa, leikkaa ja hallitsee verenvuotoa samanaikaisesti.
Argon -plasman hyytyminen, jota yleisesti kutsutaan APC: ksi, on toinen minimaalisesti invasiivinen leikkaus, joka soveltuu kudokseen. Se ei kuitenkaan vaadi suoraa yhteyttä. Tämän endoskooppisen ablaatiotoimenpiteen aikana kirurgit kuljettavat joustavan katetrin endoskoopin läpi kehoon. Kärjessä on volframielektrodi, joka vastaanottaa sähkövirran. Jalkapolkimen painaminen vapauttaa argonkaasua, joka valokaariin joutuessaan kosketuksiin virran kanssa. Kaari yksin koskettaa kudosta ja tuhoutumisen syvyys riippuu katetrin läpi virtaavasta kaasumäärästä.
Radiotaajuisessa endoskooppisessa ablaatiossa käytetään pieniä, useita, erikseen sijoitettuja elektrodeja tuomaan sähköisesti tuotettua lämpöä epänormaaliin kudokseen. Kirurgit asettavat katetrin ohjauslangan avulla endoskoopin viereen. Lääkärit käyttävät kastelunesteitä kudosten tarttumisen estämiseksi ja kirurgisen kentän puhdistamiseksi. Suorittaessaan toimenpiteen ruokatorven alueelle kirurgit voivat asettaa ilmapallon, joka täytettynä kudoskohdan ulkopuolelle pitää alueen auki ja käytettävissä. Menettely aiheuttaa tyypillisesti solujen pinnallista tuhoutumista.
Endoskooppisen ablaation kryoterapiamenetelmä käyttää nestemäistä typpeä tai jotain muuta kylmäainetta kudosten tuhoamiseen. Kirurgit asettavat kylmäkärkisen katetrin endoskooppisen instrumentin rinnalle. Yleensä poljinkäytön laukaisevat lääkärit suihkuttavat jäätyvää ainetta katetrin läpi kudokseen. Noin 10-15 sekunnin kuluttua aineen suihkuttamisesta kudos muuttuu valkoiseksi. Solut sulavat 10–30 sekunnissa ja repeytyvät paisuntasekvenssistä jäätymiseen.
Endoskooppisen ablaation jälkeen potilaat voivat kokea anestesian haittavaikutuksia. Leikkauksen jälkeiset potilaat kokevat yleensä kipua ja epämukavuutta suorasta kudosvammasta ja kudoksen laajentumisesta, koska kaasua käytetään kehon onteloiden täyttämiseen. Infektiokohtaan voi kehittyä paiseita ja infektioita, joista yleensä kertoo kuume. Verisuonitukoksia voi myös esiintyä aiheuttaen mahdollisen sydänkohtauksen, keuhkoembolian ja aivohalvauksen riskin.