Ihmisen aivot koostuvat neljästä pääalueesta: aivorungosta, pikkuaivoista, diencephalonista ja aivoista. Lähellä aivojen keskustaa sijaitseva diecephalon koostuu hypotalamuksesta, talamuksesta ja epiteelistä. Kolmesta osasta, jotka muodostavat diecephalonin, epiteeli on selkä- tai kauimpana taaksepäin. Toiminnan kannalta epitalamus on vastuussa lymbaalisen järjestelmän yhdistämisestä muuhun aivoihin sekä käpyrauhasen erittämien hormonien säätelystä.
Ihmisen aivojen sivukuvaa tarkasteltaessa epiteeli sijaitsee aivan pitkänomaisen ytimen ja aivolisäkkeen yläpuolella. Seuraamalla selkäytimen polkua kalloon, johto siirtyy aivoihin pitkänomaisen ytimen kautta ja päättyy keskiaivojen alaosaan. Hieman yläpuolella ja muutama senttimetri eteenpäin, aivolisäke lepää vaakasuoralla akselilla silmät ja korvat. Sekä medulla oblongata että aivolisäke ulottuvat epiteeliin ja siihen liittyviin komponentteihin.
Epiteelin sisällä olevia rakenteita ovat habenula, stria medularis ja käpykeho tai käpyrauhanen. Tutkijat eivät täysin ymmärrä kaikkia epiteelin eri rakenteiden toimintoja, vaikka jotkut toiminnot ovat ilmeisiä. Esimerkiksi tutkijat tietävät, että käpyrauhanen, joka sijaitsee epiteelin takana, on vastuussa vuorokausirytmien säätelystä. Melatoniini, uneliaisuudesta vastaava hormoni, erittyy käpyrauhasessa sekä ihmisissä että nisäkkäissä normaalin unisyklin aikaansaamiseksi.
“Kolmas silmä” tunnettu käpykeho osallistuu myös muihin kehon toimintoihin. Ei pienempi kuin yksi riisinjyvä, pienen käpyrauhasen melatoniinin tuotanto estää myös seksuaalista kehitystä sekä ihmisillä että eläimillä nuoruuteen asti. Myös tunteet ja tietyt motoriset reitit vaikuttavat melatoniinin ja serotoniinin läheisten samankaltaisuuksien vuoksi.
Käpyrauhasen vieressä on habenula, joka tunnetaan myös nimellä habenulaariset ytimet. Tutkijat uskovat, että habenula on mukana säätelemässä kehon ravinteiden ja veden saantia. Lisäksi tutkimukset osoittavat, että habenula sisältää affarentteja tai aistinvaraisia kuituja, jotka yhdistävät stria medulariksen muiden aivojen osien kanssa, jotka osallistuvat serotoniinin, dopamiinin ja noradrenaliinin vapautumiseen.
Talamuksen stria medularis ulottuu taaksepäin kohti habenulaarisia ytimiä. Stria medulariksesta tiedetään vähän, paitsi että se on nippu efferenttiä tai aistinlähtöä, hermokuituja, jotka on rakennettu muodostamaan harjanne talamuksen ja epiteelin välille. Jotkut anatomiatietokannat luettelevat stria medulariksen osana thalamusta, kun taas toiset luettelevat sen osana epiteeliä.