Vaikka saattaa kuulostaa siltä, että ne tarkoittavat samaa asiaa, ketoosin ja ketoasidoosin välillä on suuri ero. Silti nämä kaksi termiä sekoitetaan usein keskenään. Sen lisäksi, että sillä on sama juurisana, väärinkäsitys johtuu todennäköisesti siitä, että ketoosi ja ketoasidoosi ovat molemmat aineenvaihduntaprosesseja, joihin liittyy rasvan hajoaminen kehossa. Ketoosi on kuitenkin normaali metobolinen toiminta. Ketoasidoosi on sitä vastoin hengenvaarallinen sairaus, joka on erityisen huolestuttava tyypin I diabetesta sairastaville.
Ketoasidoosi on toksisuustila, jossa veressä on kohonneita happoja, joita kutsutaan ketoneiksi. Tämä tila ilmenee, kun insuliinitasot ovat liian alhaiset ja maksa yrittää palauttaa energiaa metaboloimalla rasvoja ja proteiineja saatavilla olevien hiilihydraattien puutteen vuoksi. Koska ketonihapot hajoavat hitaasti asetoniksi, hengitys haisee usein hedelmäiselle tai samankaltaiselle kuin kynsilakanpoistoaine. Ilman välitöntä lääkärin apua tämä tila voi aiheuttaa diabeettisen kooman ja mahdollisesti kuoleman.
Ketoosi ilmenee myös sen seurauksena, että maksa polttaa rasvaa energiaksi ja tuottaa ketonihappoja sivutuotteena. Tätä tilaa helpottaa kuitenkin usein hiilihydraattien tarkoituksellinen poistaminen ensisijaiseksi polttoaineen lähteeksi proteiinien hyväksi. Itse asiassa monet lääketieteellisen yhteisön jäsenet kutsuvat ruokavalion aiheuttamaa ketoosia tahalliseksi nälkään. Jos vähähiilihydraattinen ja runsaasti proteiinia sisältävä ruokavalio kuulostaa tutulta, se johtuu siitä, että tämä on perusta erittäin suositulle laihdutusohjelmalle, joka tunnetaan nimellä Atkinsin ruokavalio. Tällaiset ruokavaliot edellyttävät, että 30-50 prosenttia kalorien kokonaismäärästä tulee proteiineista, jotta aineenvaihdunta kiihtyy ja polttaa rasvaa.
Vaikka Atkinsin kaltaiset ruokavaliot näyttävät edistävän laihtumista, on olemassa useita vaaroja, jotka voivat liittyä kehon pitämiseen ketoositilassa. Ensinnäkin se voi rasittaa munuaisia ja johtaa lopulta munuaissairauteen tai vajaatoimintaan. Tätä ei kuitenkaan ole vahvistettu, ja tutkimus on käynnissä. Jotkut tutkimukset osoittavat, että kohonneet kolesterolitasot liittyvät ruokavalioon, jossa on paljon proteiinia, sekä syövän lisääntymiseen. Jälkimmäinen seuraus voi johtua pikemminkin antioksidanttien puutteesta kuin ketoosin vaikutuksista. Tutkimus aiheesta jatkuu.
Jotkut terveys- ja lääketieteen asiantuntijat väittävät, että vähähiilihydraattinen ruokavalio voi auttaa parantamaan tiettyjä olosuhteita, mukaan lukien liikalihavuus. Esimerkiksi American Academy of Family Physicians ja American Diabetes Association tunnustavat nyt ”vähähiilihydraattisen” ruokavalion sopivana lähestymistapana laihtumiseen. Nämä järjestöt ovat kuitenkin myös huolissaan pitkän aikavälin vaikutuksista. Sitä vastoin American Dietetic Association, National Academy of Sciences ja American Heart Association vastustavat voimakkaasti vähähiilihydraattista ruokavaliota ketoosiin liittyvien riskien vuoksi. Itse asiassa he suosittelevat vähintään 3.75 unssia (100 grammaa) hiilihydraatteja päivässä ketoosin välttämiseksi.