Keho erittää naishormoneja estrogeenia ja progesteronia keinona säätää kudosten eri toimintoja. Näitä aineita tuottavat pääasiassa naisten munasarjat ja lisämunuaiset sekä miesten lisämunuaiset ja kivekset. Estrogeeni ja progesteroni toimivat yhdessä useilla rintamilla, mukaan lukien lisääntymisjakson säätely ja naisen kehon valmistelu raskauteen.
Munasarjat erittävät estrogeenia ovulaation edistämiseksi, mikä on kypsän munasolun vapautuminen, joka voidaan hedelmöittää. Tämä aika syklin aikana tunnetaan follikulaarivaiheena. Keho erittää estrogeenia follikulaarivaiheen aikana kohdun limakalvon kehittämiseksi, jos raskaus tapahtuu ovulaation jälkeen. Paksuuntunut kohdun limakalvo edistää hedelmöitetyn munasolun istutusta.
Follikulaarivaihetta seuraava vaihe tunnetaan luteaalivaiheena, ja juuri tässä vaiheessa keho alkaa erittää enemmän progesteronia. Tämä hormoni toimii myös lisäämään verisuonten kasvua kohtuun, lisäämällä ja sakeuttamalla kohdun limakalvoa. Luteaalivaiheen aikana sekä estrogeeni että progesteroni eritetään keltarauhasesta, follikkelin jäljelle jääneestä kuoresta, joka jää munan vapautumisen jälkeen.
Jos raskaus tapahtuu, progesteroni on tarpeen istukan muodostamiseksi. Progesteroni toimii myös estämään kohdun supistuksia raskauden aikana, mikä suojaa kehittyvää vauvaa. Noin kolmen kuukauden raskauden jälkeen kehittyvä istukka ottaa estrogeenin ja progesteronin tuotannon keltarauhasesta.
Raskauden aikana progesteroni ja estrogeeni valmistavat naisen rinnat imetykseen ja kykyyn imettää vauvaa synnytyksen jälkeen. Progesteroni lisää rintamaitoa tuottavien solujen kehittymistä, kun taas estrogeeni edistää maitokanavien kasvua. Estrogeeni lisää myös kehon prolaktiinin tuotantoa, joka on rintamaidon tuotantoa tukeva hormoni.
Jos raskaus ei tapahdu luteaalivaiheen jälkeen, estrogeeni- ja progesteronitasot laskevat. Veren virtausprogesteroni oli alun perin edistänyt verisuonten kasvua. Kuukautiset, jotka tapahtuvat, kun keho irtoaa kohdun limakalvosta, jota estrogeeni ja progesteroni ovat rakentaneet, tapahtuu. Kuukautisten jälkeen follikulaarinen sykli alkaa uudelleen. Koko sykli kuukautisten ensimmäisestä päivästä siihen päivään, jolloin luteaalivaihe päättyy juuri ennen seuraavan kuukautisen alkua, kestää tyypillisesti 1 päivää.
Jotkut naiset käyttävät estrogeenia hormonikorvaushoitona vaihdevuosiin liittyvien epämiellyttävien oireiden vähentämiseksi. Vaihdevuosien aikana munasarjat erittävät vähemmän estrogeenia aiheuttaen oireita, kuten suun kuivumista, emättimen kuivuutta, kuumia aaltoja ja mielialan vaihteluita. Estrogeenikorvausta voidaan antaa oireiden esiintyvyyden vähentämiseksi ja osteoporoosin suojaamiseksi. Progesteronikorvaushoitoa voidaan lisätä estrogeenihoitoon naisille, joille ei ole tehty kohdunpoistoa.