Mikä on genomikirjasto?

Genomikirjasto on kokoelma bakteereja, jotka on geneettisesti muokattu pitämään organismin koko DNA. Kirjaston koko vaihtelee riippuen siitä, miten DNA varastoidaan bakteereihin, ja organismin genomin pituudesta. Genomikirjastoja käytetään geenitutkimuksessa ympäri maailmaa erilaisissa laboratoriolaitoksissa. Yritykset, jotka valmistavat genomikirjastoja, voivat tarjota niitä erikoistilauksesta tutkijoille.

Genomisen kirjaston kokoaminen alkaa tutkittavan organismin DNA: n käsittelemisestä siten, että se hajoaa hallittaviksi paloiksi, jotka on järjestetty pituuden mukaan ja asetettu sitten kloonausvektoreihin, kuten plasmideihin. Eri vektorit voivat tallentaa erilaisia ​​määriä DNA: ta. Kun DNA on lisätty, vektori voidaan viedä bakteereihin. Yhdessä bakteerikokoelmassa on organismin täydellinen genomi.

Kun genominen kirjasto on tuotettu, tutkijat voivat työskennellä sen kanssa monella eri tavalla. He voivat esimerkiksi etsiä erityisiä DNA -ketjuja kirjastosta käyttämällä koettimia, jotka on suunniteltu tunnistamaan ja merkitsemään spesifisiä aminohapposekvenssejä. Koettimen avulla sekvenssit voidaan eristää jatkotutkimuksia ja analyysejä varten saadakseen lisätietoja tietyistä mielenkiinnon kohteista genomissa. Genomikirjasto voidaan myös tallentaa, jäädyttää tulevaa käyttöä varten. Niin kauan kuin sitä pidetään vakaissa olosuhteissa, se voi kestää erittäin pitkään.

Genomikirjaston avulla tutkijat voivat tutkia organismin genomia saadakseen lisätietoja genomista rakenteesta ja toiminnasta. Ne voivat myös kartoittaa genomin ja tunnistaa tiettyjen geenien sijainnit. Tästä tiedosta tulee erittäin hyödyllistä, kun tutkijat haluavat kehittää testejä, joita voidaan käyttää paikantamaan geneettisiä muunnelmia, mukaan lukien mutaatiot, jotka voivat liittyä synnynnäisiin olosuhteisiin. Mitä syvempi ymmärrys organismin genomista on, sitä enemmän tutkijat voivat tietää koko organismista.

Genomikirjastoa voidaan käyttää myös DNA -segmenttien kloonaamiseen. Isäntä voi kopioida isäntäbakteerien vektorit luodakseen useita kopioita kiinnostavasta segmentistä, ja näitä kopioita tutkitaan edelleen tai lisätään muihin vektoreihin geneettistä muuntamista ja muita tutkimustarkoituksia varten. Esimerkiksi kloonattuja materiaaleja voitaisiin lisätä viljelykasveihin tiettyjen muutosten tekemiseksi, jotta voidaan parantaa sadon suorituskykyä.