Tunnetuin merkki herpesistä miehillä on kuoppia tai rakkuloita sukupuolielimissä tai peräaukossa. Miehellä voi kuitenkin olla oireita, ennen kuin hän voi nähdä tunnistettavia herpes -kuoppia; miehen sukupuolielinten iho ärsyyntyy ja punastuu usein ennen niiden ilmestymistä. Lopulta kuoppia muuttuu rakkuloiksi ja ne voivat lopulta muuttua avoimiksi haavaumiksi. Jonkin ajan kuluttua haavaumat yleensä pysäyttävät verenvuodon tai nesteen ja huuhtelun. Kun haavaumat ovat parantuneet, muita oireita ei välttämättä ole ennen seuraavaa puhkeamista, joka voi tapahtua viikkoja myöhemmin tai vasta kuukausien tai jopa vuosien kuluttua.
Monet uskovat, että miehellä on aina haavaumia peniksessään, jos hänellä on herpes, mutta tämä on väärinkäsitys. Herpes voi aiheuttaa kuoppia ja haavaumia peniksen lisäksi myös kivespussiin. Haavaumia voi kehittyä jopa peräaukon alueelle ja asianomaisen miehen reisiin. Tämä tarkoittaa, että peniksen silmämääräinen tarkastus ei ehkä riitä varmistamaan, että seksikumppanissa ei ole herpesiä. Se tarkoittaa myös sitä, että kondomin käyttö ei välttämättä tarjoa 100-prosenttista suojaa tältä sukupuolitaudilta.
On syytä huomata, että yksi herpesin oireista miehillä voi olla kuoppa tai kipeä, joka on piilotettu paljaalla silmällä. Nämä kuoppia muodostuu joskus miehen virtsaputkeen. Virtsaputki on putki, jonka kautta virtsa kulkee ulos kehostaan.
Jos kouristuksia tai haavaumia ei ole sukupuolielimissä, peräaukossa tai ympäröivillä alueilla, se ei välttämättä tarkoita sitä, että mies ei voi siirtää herpestä seksikumppanille. Virus on mahdollista välittää, vaikka tartunnan saaneella ei olisi oireita eikä hänellä ole ollut niitä pitkään aikaan. Lisäksi virus on mahdollista levittää sekä hetero- että homoseksuaalisen kontaktin kautta, ja se voi levitä myös suuseksin kautta.
Mielenkiintoista on, että miehellä voi olla herpes, mutta hän ei ole täysin tietoinen siitä, että hän on saanut tartunnan. Tämä voi tapahtua, kun ensimmäinen puhkeaminen on liian lievä ollakseen havaittavissa. Se voi tapahtua myös silloin, kun miehellä on vakava taudinpurkaus, mutta hän ei koskaan näe lääkärin diagnoosia. Koska voi kestää vuosia ennen kuin hän kokee uudelleen herpes -oireita, hän ei ehkä ymmärrä, että hänellä on sukupuolitauti.