Hirudiini on lääkeaineiden valmistama yhdiste, joka häiritsee kehon kykyä muodostaa verihyytymiä. Iiloja on käytetty lääketieteessä vuosisatojen ajan. Tällä hetkellä niitä käytetään erilaisiin tiloihin, jotka hyötyvät verihyytymien poistamisesta. Tällainen antikoagulaatio käsittää trombiiniproteiinin estämisen, joka katalysoi verihyytymän muodostumista. Elävien iilimatojen käyttö vaarantaa bakteerien pääsyn haavaan, ja hirudiinia käytetään yleensä yksinään veren hyytymisen estämiseksi.
Lääkinnälliset iilimatot, Hirudo medicineis, tuottavat sylkirauhasissaan useita yhdisteitä, jotka auttavat isäntien verenvuotoprosessissa, joka tunnetaan nimellä hirudoterapia. Ne tuottavat anestesia -aineita, joten isäntä ei todennäköisesti huomaa sitä, kun iilimatka kiinnittyy niihin. Seoksessa on myös yhdisteitä, jotka estävät veren hyytymistä, joten se virtaa vapaammin leechiin. Veri pysyy tukkeutumattomana, vaikka iilimatto on irronnut. Elävien iilimatojen käytöllä antikoagulaatioon on joitain haittoja, koska ne voivat tuoda bakteereja haavaan.
Syljessä oleva yhdiste, joka on spesifisin antikoagulaatiolle, on peptidi hirudiini. Tämä on 65 aminohapon ketju, joka löydettiin ensimmäisen kerran vuonna 1884. Rakenne määritettiin vasta vuonna 1976. Iilimatoissa on vain pieni määrä tätä yhdistettä syljessään, ja hirudiinia on useita eri muotoja sekoitettuna keskenään. Suurin osa lääketieteellisesti käytetystä puhtaasta yhdisteestä on peräisin geneettisesti muunnetusta peptidistä.
Veren hyytymiseen liittyy liukoisen proteiinin, nimeltään fibrinogeeni, muuttuminen liukenemattomaksi verkkofibriiniksi. Tätä reaktiota katalysoi trombiini-niminen entsyymi, joka on proteaasi ja voi pilkkoa muita proteiineja. Kun trombiini inaktivoituu, fibriiniä ei muodostu eikä veri enää hyyty.
On olemassa erilaisia trombiinityyppejä. Hirudiini inaktivoi vain sen trombiinityypin, joka on spesifisin fibrinogeenille, ja siksi se on tehokkain trombiinia estävä yhdiste. Se on jopa spesifisempi kuin kehon oma trombiinin estäjä, antitrombiini III.
Antikoagulaatiohoidosta hyötyvät olosuhteet ovat suonikohjut ja geneettiset häiriöt, joissa veri hyytyy liikaa. Hirudiini voi vaikuttaa trombiiniin, joka on muodostanut verkon ja muodostaa hyytymän. Tilannetta, jossa tällaisia hyytymiä on verisuonten sisällä, kutsutaan tromboosiksi. Tämä peptidi voi jopa vaikuttaa kompleksoituneeseen trombiiniin, ja tämä kyky antaa sille edun lääkkeeseen hepariiniin verrattuna, jota käytetään myös antikoagulanttina.