Howard Hughes Medical Institute (HHMI) on voittoa tavoittelematon lääketieteellinen tutkimusorganisaatio, joka on omistettu biolääketieteelliseen tutkimukseen ja koulutukseen. Instituutti on yksi suurimmista hyväntekeväisyysjärjestöistä Yhdysvalloissa, ja se jakaa tyypillisesti satoja miljoonia Yhdysvaltain dollareita (USD) vuosittain tieteellisen tutkimuksen tukemiseksi. Sen tehtävänä on tuoda ihmiskunta lähemmäs elämän peruskysymysten ymmärtämistä.
Vuonna 1905 syntynyttä Howard Hughesia pidettiin loistavana ja eksentrisenä miehenä, ja hänestä tuli miljardööri. Hän otti vaatimaton perinnön ja muutti oman yrityksensä, Hughes Aircraft Companyn, yhdeksi Yhdysvaltojen suurimmista puolustusurakoitsijoista. Hänen laulava saavutus oli Howard Hughes Medical Institutein perustaminen, joka sijaitsee Chevy Chase, Maryland.
Hughes perusti instituutin vuonna 1953 ja kartoitti organisaation tietyillä biolääketieteellisen tutkimuksen aloilla, joita se tukisi. Aluksi painopistealueita olivat genetiikka, solubiologia, rakennebiologia, neurotiede ja immunologia. Vuonna 1987 instituutista tuli suurin yksityinen organisaatio, joka on sitoutunut parantamaan luonnontieteellistä koulutusta Yhdysvalloissa.
Yksi Howard Hughes Medical Institutein ensisijaisista tehtävistä on myöntää apurahoja tiedeyhteisön yksilöille ja instituutioille. Näiden apurahojen tavoitteena on muuttaa tapaa, jolla tieteellistä tutkimusta tehdään ja tiedettä opetetaan ja ymmärretään. Vuodesta 1988 lähtien instituutti on myöntänyt apurahoja yli 1.4 miljardia dollaria.
Sen toinen päätehtävä on laajentaa tieteellisen tutkimuksen rajoja eri aloilla, mukaan lukien tuberkuloosin (TB) ja ihmisen immuunikatoviruksen (HIV) kaltaisten sairauksien tutkimus. Instituutin perustamia ohjelmia ovat Howard Hughes Medical Institute Investigators, Early Career Scientists, Janelia Farm Research Campus, Collaborative Innovation Awards, International TB/HIV Initiative ja International Research Scholars.
Tutkijat-ohjelma on instituutin lippulaiva biolääketieteen tutkimusohjelma, ja se työllistää useita satoja kokopäiväisiä tutkijoita. Jokaisen tehtävänä on kehittää erityinen biolääketieteen tutkimusohjelma. Tutkijoiden joukossa on yli kymmenkunta Nobel -palkinnon saajaa.