Ivermektiini hevosille on yksi tehokkaimmista menetelmistä loisten hoitoon ja ehkäisyyn. Lääke toimii torjumaan 35 erilaista loisorganismia, mukaan lukien strongyles, useita matoja ja botteja. Matoja, joita se voi hoitaa ja hallita, ovat pinworms, keuhkomatot ja suoliston hiusmatot. Sitä pidetään turvallisena käyttää kaikilla hevosilla, vaikka valmistajat suosittelevat sitä käyttämättä eläimille, jotka on tarkoitettu elintarvikkeiksi. Ivermektiini lamauttaa parasiittien välittäjäaine gamma-aminovoihapon (GABA). Tämä happo on ainutlaatuinen loisorganismeille, joten tyypillinen ivermektiiniannos ei vaikuta selkärankaisiin, kuten hevosiin. Se voi estää uusia infektioita loisista ja toimii myös tuhoamaan aktiivisia infektioita.
Omistajat voivat ostaa ivermektiiniä hevosille tahna -muodossa. Sitä myydään usein muoviruiskussa, joka sisältää tarpeeksi lääkettä yhdelle tai useammalle täysikasvuiselle hevoselle. Lääkkeen antamiseksi ruiskun kärki on työnnettävä hevosen suuhun. Tahna ruiskutetaan sitten eläimen kielen takaosaan. Omistajia kehotetaan usein pitämään hevosen päätä ylöspäin, jotta se ei voi sylkeä lääkettä. Yliannostuksen katsotaan olevan erittäin vaikeaa, kun ivermektiiniä käytetään hevosille. Eläinten on tiedetty nauttivan jopa yhdeksän kertaa suositeltua annosta ilman sivuvaikutuksia. Ivermektiinin antaminen loisten torjumiseksi voidaan aloittaa, kun hevonen on kuuden tai kahdeksan viikon ikäinen.
Lääke on niin tehokas loisten torjunnassa, että eläinlääkärit suosittelevat usein sen vaihtamista toiseen hoitotyyppiin satunnaisesti. On huolestuttavaa, että loiset kehittävät lopulta resistenssin ivermektiinille hevosille, mikä tekee siitä tehottoman. Samaan aikaan eläinlääkärit varoittavat pyörivistä madonmatoista liian usein ja sanovat, että tämä voi aiheuttaa loisille vastustuskykyä useille lääkkeille kerralla. Suositeltava toimintatapa on työskennellä läheisessä yhteistyössä eläinlääkärin kanssa, kun hevosille annetaan matohoito -ohjelmaa.
Ivermektiinin käyttö hevosille on toisinaan tiedetty aiheuttavan sivuvaikutuksia. Turvotusta ja kutinaa on esiintynyt joillakin hevosilla sen jälkeen, kun heidät on käsitelty ivermektiinillä lankakaulamikrofilariaan. Uskotaan, että reaktiot johtuivat siitä, että suuri määrä mikrofilariaeja kuoli pois kerralla. Ivermektiiniä pidetään erittäin turvallisena hevosille, mutta ihmisiä kehotetaan pesemään kätensä lääkkeen käsittelyn jälkeen. Käytettyjä ivermektiiniruiskuja ei saa hävittää vesilähteessä, koska ne voivat vahingoittaa tai tappaa selkärangattomia vedessä.