Kasvipatogeeni on tautia aiheuttava organismi, joka hyökkää kasveja vastaan. Kasvien taudinaiheuttajat ovat kiinnostavia monista syistä aina hauraista ekosysteemeistä huolenaiheisiin ja haluan suojella elintarvikkeiden tarjontaa. On olemassa monenlaisia patogeenejä, jotka voivat kohdistaa kasveja, mukaan lukien virukset, bakteerit, alkueläimet, loiset, matot ja arkeat. Kasvipatogeenejä tutkivia ihmisiä kutsutaan kasvipatologeiksi tai kasvipatologeiksi.
Kasvien patogeenit voivat hyökätä useilla eri tavoilla. Jotkut kolonisoivat kasvin kudoksen, toiset laskeutuvat kasvin pinnalle, ja toiset voivat mennä tietyille alueille, kuten juurille, varret ja lehdet. Taudinaiheuttajat aiheuttavat yleensä ongelmia, kuten kudoskuoleman, ruskistumisen, hedelmän vähenemisen, kukkien asettamisen ongelmia ja niin edelleen. Äärimmäisissä tapauksissa ne voivat tappaa isäntäkasvin.
Ihmisiin hyökkäävien taudinaiheuttajien tavoin kasvien patogeenit ovat hyvin erilaisia. Kasvipatogeeni on saattanut kehittyä hyökkäämään tiettyyn sukuun tai kasvilajiin tai tarttumaan laajemmin useimpiin kasveihin. Jotkut kasvien patogeenit hyödyntävät erityisiä biologisia prosesseja, joita voi esiintyä isäntälajeissa, kun taas toiset tyytyvät käyttämään kasveja kotona, koska niillä on arvokkaita resursseja, kuten ravinteita.
Maataloudessa kasvitaudit aiheuttavat vakavia vahinkoja vuosittain. Kun kasvien patogeeni on hyökännyt kasvin kimppuun, sen tuotteita ei yleensä voida myydä. Taudinaiheuttaja tekee investoinnin laitokseen hyödyttömäksi, ja yleensä suuria kustannuksia aiheutuu taudinaiheuttajien hävittämisestä pellolta ja muiden tartunnan aiheuttamien laskeumien käsittelystä. Joissakin tapauksissa pelto tulee niin sairaaksi, että sen on annettava kesannoida useita vuosia toipuakseen, ennen kuin siellä yritetään kasvattaa satoa uudelleen.
Kasvipatogeeni voi myös olla huolestuttava, kun se tuodaan vahingossa tai tuodaan tarkoituksellisesti haavoittuvaan ekosysteemiin. Jotkut saarivaltiot ovat erityisen huolestuneita tästä, koska niillä on ainutlaatuinen kasvisto, jonka mantereen tuoma patogeeni voi tuhota. Taudinaiheuttajat voivat myös olla ongelma, kun ne leviävät alueiden välillä; esimerkiksi viinirypäleitä hyökkäävä ja Eurooppaan rajoittuva taudinaiheuttaja voi olla suuri uhka, jos se saavuttaa Australian viinitiloja, jotka eivät ehkä ole valmiita taudinaiheuttajan hallintaan.
Ekologit ovat kiinnostuneita kasveja saastuttavien taudinaiheuttajien tutkimuksesta ja niiden vaikutuksista eri lajeihin ja ekosysteemeihin. Kun kasvit kokevat kuolemantapauksia ja muita ongelmia, kasvitauti on usein syy, ja patologi voidaan kutsua selvittämään, mikä taudinaiheuttaja on vastuussa, ja laatimaan suunnitelma sen hallitsemiseksi.