Kaupunkien puhtaanapito on sanitaatiomuoto, joka keskittyy saniteettiolosuhteiden ylläpitämiseen kaupunkiympäristössä. Monet ihmiset ajattelevat erityisesti ihmisjätteen keräämistä, käsittelyä ja hävittämistä, kun he kuulevat sanat “kaupunkien sanitaatio”, mutta kaupunkiympäristön sanitaatio on paljon monimutkaisempi järjestelmä. Sanitaatio on erityisen kiireinen ongelma slummeissa, joissa tungosta ja huonoista sanitaatioista johtuvat usein tautipesäkkeet, jotka uhkaavat slummien asukkaita ja altistavat muita kaupungin asukkaita terveysriskeille.
Historiallisesti kaupunkiyhteisöt eivät juurikaan ajatelleet sanitaatiota, mikä muuttui suureksi ongelmaksi joillakin alueilla. Monien kaupunkikatujen reunat olivat täynnä roskia, joihin saattoi kuulua kuolleita eläimiä sekä käsittelemätöntä ihmisjätettä. Kaupunkikatuilla käveleminen oli välttämisen harjoitus, koska ihmiset heittivät vapaasti roskia ja ihmisjätettä kadulle välittämättä ohikulkijoista, ja taudit levisivät kaduilla ja kaupunkien vesiväylillä syntyvien jätteiden vuoksi. Kasvava käsitys hygieniasta yhdistettynä sosiaaliseen paineeseen ihmisten saamasta elämään saastaisesti johti lopulta kehitykseen tai kaupunkien puhtaanapitoon.
Kaupunkien sanitaation tarkoitus on vähentää ihmisten terveydelle aiheutuvia riskejä hallitsemalla kaupunkiympäristön tekijöitä, jotka voivat vaikuttaa terveysongelmiin. Yksi tärkeimmistä tekijöistä on ihmisten jätteet, joita syntyy suuria määriä kaupunkialueilla. Viemärit, jotka keräävät tällaista jätettä ja ohjaavat sen keskuskäsittelylaitoksiin, ovat siksi keskeinen osa kaupunkien sanitaatiota. Samoin julkisten wc -tilojen kaltaiset tilat, jotka estävät ihmisiä käyttämästä katuja kylpyhuoneena, sekä kannettavat wc -tilat suurissa tapahtumissa, joiden tarkoituksena on tarjota osallistujille paikka hävittää jätteet turvallisesti.
Kaupunkien puhtaanapitoon kuuluu myös vesihuoltojen hallinta. Hyvä sanitaatiopalvelu koskee turvallisen juomaveden tarjoamista kansalaisille. Tähän voi kuulua kaivojen eristäminen niiden saastumisen estämiseksi, vesivarojen turvaaminen kaupungin ulkopuolelta ja turvallisen putkiverkoston kehittäminen veden toimittamiseksi asukkaille.
Sanitaatio -osastojen on myös huolehdittava roskista. Useimmilla kaupunkialueilla on jätteenkeräyspalvelu, jonka avulla kansalaiset voivat asettaa roskansa tiettynä päivänä keräilijäryhmille, jotka keräävät sen ja toimittavat sen käsittelylaitokseen. Kierrätys ja kompostointi voivat olla osa yhdyskuntajätteen keräystä, jonka tarkoituksena on vähentää ympäristön kuormitusta ja tarjota lisätuottoa jätehuoltovirastolle, mikä pitää kulut alhaisina.