Mikä on Kilobase?

Kilobase on numerointimittaus, jota käytetään genetiikan alalla. Koska perusta on yksi geneettisen tiedon rakennuspalikka ja jokainen organismi sisältää monia emäksiä, 1,000 emästä on yleinen luku, jota käytetään keskusteltaessa siitä, kuinka monta emästä organismin geneettinen kirjasto sisältää. Tätä 1,000 XNUMX peruspalaa kutsutaan oikeammin kilobaasiksi.
Jokainen elävä organismi sisältää geneettistä tietoa. Tämä tieto osoittaa organismille täsmälleen, mitä proteiinituotteita elimistö tarvitsee elääkseen, kasvaakseen ja lisääntyäkseen. Kaikkia geneettisiä tietoja yhdessä kutsutaan organismin genomiksi.

Jokainen genomi on jaettu erillisiin osiin. Nämä osiot, joita kutsutaan geeneiksi, koodittavat tiettyä tuotetta. Jokainen geeni sisältää merkkijonon rakennuspalikoita, joita kutsutaan emäksiksi. Kun organismi lukee geenit tuottaakseen tietyn tuotteen, se lukee geenin sisältämien emästen sekvenssin.

Geneettisessä materiaalissa on vain neljä emästä. Nämä ovat sytosiini (C), guaniini (G), tymiini (T) ja adeniini (A). Se, missä järjestyksessä emäkset on järjestetty geeniin, määrää sen, mitä kyseinen geeni koodaa. Kaikkien ihmisten elämälle välttämättömien tuotteiden valmistamiseksi tarvittava monimutkaisuus johtuu geenien pituudesta ja niiden sisältämien emästen lukumäärästä.

Kukin geeni sisältää huomattavan määrän emäksiä. Esimerkiksi koko ihmisen genomi sisältää 3 miljardia emästä, joista jokainen on yhdistetty toiseen emäkseen spiraalikierukkarakenteessa. Pelkkä emästen määrä genomissa tarkoittaa, että geenitieteilijöiden on helpompi viitata geeneihin, joiden pituus on x kilobaasia, toisin kuin 1,000 kertaa x pituus.

Pienimmätkin genomit, kuten Carsonella ruddii -bakteerin genomi, sisältävät noin 160,000 160 emäsparia. Tämä pieni genomi on noin 3 kilobaasia (kb) pitkä. Ihmisen genomi on sen sijaan XNUMX miljoonaa kilobaasiparia pitkä.
Genomien sekvensointi edellyttää, että genomi hajotetaan ensin. Laitteet, jotka suorittavat sekvensoinnin, voivat käsitellä vain niin monta emästä kerrallaan. Geenitieteilijät voivat jakaa genomin useisiin osiin ja viitata niihin siten, että ne sisältävät niin monta kilopohjaparia, kuten 150 kilobaasiparia. Tämän kokoinen geneettinen materiaali voidaan muuntaa geneettisesti toiseksi organismiksi DNA: n moninkertaistamiseksi tasolle, joka on helposti luettavissa. Jopa nämä suhteellisen pienet DNA-palaset ovat liian pitkiä suoraan sekvensoimiseksi, joten geneetikot voivat sitten hajottaa 150 kb: n segmentin paljon pienemmiksi, muutaman sadan emäksen pituisiksi osiksi.