Kliininen anatomia on ihmisen anatomian tutkimus, joka liittyy kliiniseen käytäntöön. Sen sijaan, että kliininen anatomia olisi suunniteltu mahdollistamaan jonkun hankkia yleistä anatomista tietoa, se keskittyy tiettyihin rakenteisiin ja ongelmiin, joita ihmiset voivat kohdata kliinisessä ympäristössä. Monet lääkärit, erityisesti kirurgit, opiskelevat rutiininomaisesti kliinistä anatomiaa ja osallistuvat kertauskursseille, jotta heidän anatomiantaitonsa pysyvät korkeina ja jotta he voivat perehtyä alansa uusiin tekniikoihin.
Yleinen ihmisen anatomian tutkimus voi olla erittäin hyödyllinen monille lääkärin ammatissa työskenteleville ihmisille, koska sen avulla he voivat tutkia kehon rakenteita ja tapaa, jolla kehon järjestelmät liittyvät toisiinsa. Monet lääketieteelliset koulut vaativat oppilaitaan suorittamaan yleisen anatomian kurssin ensimmäisen vuoden aikana, ja lääketieteen opiskelijat testataan rutiininomaisesti anatomisista tiedoista.
Kliinisen anatomian alalla lääkärit ottavat yleiset anatomian taidot ja soveltavat niitä erityisiin kliinisiin tilanteisiin. Esimerkiksi silmälääkäri luottaa tietoonsa silmän anatomiasta diagnosoidakseen ja hoitaakseen potilaita, ja hän voi käyttää valokuvia, anatomisia näytteitä ja muita keinoja pysyäkseen tuttuina silmän rakenteista. Kliinisen anatomian tuntemuksen ansiosta joku voi huomata anatomisen poikkeavuuden, ja sitä käytetään oppaana kaikenlaisiin lääketieteellisiin toimenpiteisiin sydämen venttiilin vaihdosta murtuneen luun halkaisuun.
Monet lääkärit täydentävät yleisen anatomian kurssejaan erityisillä kliinisen anatomian tunneilla koulutuksen edetessä ja he valitsevat erikoisuuksia. Lääketieteellisissä kouluissa ja tutkimuslaitoksissa järjestetään myös määräajoin täydennyskoulutusta päteville lääketieteen ammattilaisille, jotka haluavat mahdollisuuden työskennellä anatomian laboratoriossa ja tutkia anatomiaa kliinisten kokemustensa perusteella. Esimerkiksi polven rekonstruktioihin erikoistuneet kirurgit voivat ajoittain leikata ruumiinpolvia muistuttaakseen itseään kaikista polven rakenteista ja perehtymään erilaisiin vaihteluihin, joita voidaan nähdä ihmisen polvessa.
Lääkärien ammattijärjestöillä on usein kliinisen anatomian osasto, joka julkaisee päiväkirjaa, pitää kursseja ja tarjoaa muita mahdollisuuksia lääkäreille harjoitella heidän erikoisuuteensa liittyvää anatomiaa. Nämä organisaatiot voivat myös tehdä tutkimusta, joka on suunniteltu lisäämään kliinisen anatomian tuntemusta ja kehittämään uusia tekniikoita, hoitoja ja protokollia tämän lisääntyneen tiedon valossa. Kliinisen anatomian pitkäaikaistutkimus voi myös antaa paljastavaa tietoa ihmisten terveydentilasta, kuten hiukkasten kertymisestä, joka on havaittu monien kaupunkilaisten keuhkoissa.