Immuunijärjestelmän solujen, kuten T -solujen ja B -solujen, pinnalla on proteiineja, joiden avulla ne voivat tunnistaa vieraat hyökkääjät ja hyökätä niihin. Näiden proteiinien alueet voivat vaihdella solusta toiseen, jolloin ne voivat reagoida erilaisiin uhkiin. Joskus tuotetaan T -soluja ja B -soluja, jotka reagoivat proteiineihin, joita kehon omat solut ilmentävät, joita kutsutaan autoantigeeneiksi. Klooninen deleetio on prosessi, jonka avulla nämä solut voidaan neutraloida ennen kuin ne vapautetaan kehoon, missä ne voivat mahdollisesti hyökätä terveen kudoksen kimppuun.
T -soluja tuotetaan luuytimessä, mutta ne kypsyvät kateenkorvassa, sydämen lähellä olevassa rauhassa, ja B -soluja tuotetaan luuytimessä. Huolimatta erilaisista lähtöpaikoistaan, molemmat solutyypit käyttävät samanlaista klonaalisen deleetion menetelmää varmistaakseen, että kypsät immuunisolut, jotka reagoivat autoantigeeneihin, eivät vapaudu verenkiertoon. Kypsymisprosessin aikana nämä solut joutuvat kosketuksiin rajallisen soluvalikoiman, kuten makrofagien, ja kateenkorvan dendriittisolujen kanssa. Näillä soluilla on erilaisia pintaproteiineja, joita kutsutaan antigeeneiksi, joita ne esittävät immuunisoluille, jotta ne reaktiota tuottavat solut voidaan kitkeä pois.
Kateenkorvan käyttämiseksi esimerkkinä kateenkorvan dendriittisolut käyttävät esitysprosessia, jonka avulla T -solut voivat yrittää sitoa pintaproteiineja ja seuloa niitä kloonaalisen poiston varalta. Epäkypsät T -solut, jotka reagoivat näihin autoantigeeneihin, muodostavat proteiinikompleksin kateenkorvan solun kanssa. Siinä tapauksessa, että tämä proteiinikompleksi muodostuu, se laukaisee T-solussa itsetuhoisen sekvenssin, jota kutsutaan apoptoosiksi, niin että se ei kypsy ja pääse kehoon, missä se voi mahdollisesti käynnistää haitallisen vasteen, jos se kohtaa toisen solun, jolla on tuo proteiini.
Keho sisältää monia muita solutyyppejä kuin kateenkorvassa ja luuytimessä, joten klonaalisen deleetion on otettava huomioon autoantigeenit, joita ei tavallisesti löydy näistä kudoksista. Kateenkorva tekee tämän tekemällä kateenkorvan dendriittisoluja, jotka sisältävät pintaproteiineja, joita tavallisesti löytyy muualta, kuten haiman kudoksesta. Sitten kloonaalinen deleetio voi tapahtua immuunisolujen kanssa, jotka normaalisti reagoisivat näihin haiman proteiineihin, ja samanlainen prosessi säätelee luuytimessä kypsyvää B -solua. Jotkut sairaustilat, kuten diabetes, voivat johtua osittain siitä, että keho ei pysty esittämään kaikkia kehon antigeenejä kypsyville immuunisoluille, jolloin nämä solut kypsyvät ja hyökkäävät terveen kudoksen kimppuun.