Kolmannen silmän meditaatio on tekniikka, jolla harjoittelija yrittää laajentaa tietoisuutta poistamalla mielessä pettymyksen kerrokset. Tämän uskotaan lepäävän kolmannessa silmässä, joka on aivolisäke, joka lepää päässä, kulmakarvojen välisellä alueella. Menetelmää käytetään lisäosana säännöllistä meditaatiokäytäntöä.
Uskotaan, että kolmannen silmän meditaatio palauttaa yleismaailmallisen tietoisuuden, joka ihmisillä on luonnostaan lapsena. Käytännön tarkoituksena on palauttaa ajatuksen puhtaus siitä ajasta elämässä, jolloin henkilö ei tiennyt merkinnöistä ja niiden sisältämistä rajoituksista. Esimerkiksi vauva ei tietäisi kasvin nimeä tai sen sisältämiä ominaisuuksia, joten sen mahdollisuudet ulottuisivat aikuisten tavanomaisen viisauden ulkopuolelle. Lapsi voisi kuvitella sen niin moniksi asioiksi ja pysyä siten avoimena ja vapaana mahdollisesta pelosta johtuen mahdollisista kasviin kiinnitetyistä tarroista.
Käytännössä kolmannen silmän meditaatio poistaa henkisen tukoksen alueelta, jotta mielen puhtaus ja yleinen tietoisuus voidaan saavuttaa. Jokaisella harjoituksella poistetaan silmästä toinen kerros, kuten pölykerros. Ajatuksena on, että tämä tukos poistuu tasaisesti, kunnes kolmas silmä näkee täysin selkeästi.
Monet kolmannen silmän menetelmän harjoittajat aloittavat käyttämällä tavanomaisia meditaatiomenetelmiä, kuten istumista rennossa mutta pystyssä asennossa ja hengittämistä hitaasti ja syvästi silmät kiinni. Silloin on tavallista päästää mieli pois ajatuksista. Harjoittajat voivat sitten keskittyä kehon eri chakroihin tai energiakeskuksiin.
Kolmannen silmän meditaatiokäytännön keskipisteenä on keskittyminen kulmakarvojen väliseen alueeseen. Kun harjoittelija on rentoutunut kunnolla, hän voi fyysisesti katsoa ylös tai yksinkertaisesti kuvitella paikan. Molempia menetelmiä voidaan kokeilla harjoituksen alkuvaiheessa, mutta yksi on tyypillisesti valittu pitkän aikavälin kolmannen silmän meditaatioon. Kun keskittyminen alueeseen on saavutettu, uskotaan, että alueelta tulee valoa, joka tarjoaa selkeyttä ja rauhaa.
Henkisen heräämisen lisäksi kolmannen silmän meditaatiolla uskotaan olevan myös joitain käytännön sovelluksia. Harjoituksen uskotaan olevan hyvä rentoutumis- ja stressinpoistotekniikka. Tämä johtuu ensisijaisesti siitä, että se keskittyy poistamaan jännitteitä aiheuttavat rajoitukset ja ahdistukset.