Koulut, kuten monet muutkin organisaatiot, noudattavat tavanomaisia organisaatiorakenteita. Heillä on selkeä hierarkia ja selkeät rajat sille, mitkä työntekijät tai osastot ovat vastuussa erilaisista koulun toimintaan liittyvistä tehtävistä. Kuten yritysten ja voittoa tavoittelemattomien järjestöjen kohdalla, koulun organisaatiorakenne määrittelee, kuka raportoi kenelle ja kuka on vastuussa mistäkin. Kouluissa on tyypillisesti ylläpitäjiä, jotka vastaavat koko koulun toiminnasta ja valvonnasta, sekä eri aineiden opettajia, jotka on jaettu ryhmiin arvosanojen tai akateemisten aihealueiden perusteella. Heillä on myös toimistotyöntekijöitä ja tukihenkilöstöä suorittamaan erilaisia koulun toiminnassa tarvittavia toimintoja.
Koulun organisaatiorakenteessa on usein mukana hallinnon jäseniä, lisensoitu ja lisensoimaton tukihenkilöstö ja opettajia. Hallintoon kuuluu usein koko koulusta vastaava rehtori ja yksi tai useampi apulaisrehtori. Järjestelmänvalvojat huolehtivat oppilaiden ja opettajien valvonnasta ja tekevät koulunlaajuisia päätöksiä, joskus kuultuaan opettajia ja muita henkilökunnan jäseniä. Koulun hallintoryhmä on vastuussa koulun sääntöjen ja piiritason käytäntöjen, sääntöjen ja menettelyjen laatimisesta ja täytäntöönpanosta. Järjestelmänvalvojien tehtävänä on myös varmistaa, että opettajat opettavat tehokkaasti opiskelijoille vaaditun opetussuunnitelman.
Peruskouluissa ja yläasteilla opettajat jaetaan yleensä ryhmiin oppilaiden arvosanan perusteella, vaikka myös yläkoulujen opettajat voidaan jakaa ryhmiin akateemisten ydinalueiden, kuten kielitaiteen, matematiikan, luonnontieteiden ja yhteiskuntatieteiden, perusteella. Lukion opettajat ovat yleensä akateemisilla osastoilla, jotka perustuvat akateemisiin aihealueisiin ydinalueilla, sekä osastoille, kuten liike -elämälle, vieraalle kielelle ja uralle. Opettajien tiimit tai osastot suunnittelevat usein erikseen ja yhdessä varmistaakseen, että he kaikki opettavat vaadittua opetussuunnitelmaa ja palvelevat oppilaitaan parhaansa mukaan. Osastopäälliköt tai johtavat opettajat ovat tyypillisesti vastuussa tiimistään tai osastostaan ja toimivat yhteyshenkilönä koulun ylläpitäjille ja mahdolliselle pääopettajalle tai opetussuunnitelman ohjaajalle.
Kouluissa on tyypillisesti tukihenkilöstöä, jotka vastaavat eri osastoista ja olennaisista tehtävistä. Toimiston henkilökunta on vastuussa vierailijoiden, saapuvien puheluiden ja tehtävien, kuten päivittäisen läsnäolon, hoitamisesta sekä opettajien ja opiskelijoiden tarpeiden hoitamisesta. Ohjausosasto tarjoaa neuvontaa opiskelijoille, ja se vastaa standardoidusta testauksesta ja uran, terveyden ja turvallisuuden tiedon levittämisestä. Kahvilatyöntekijät tarjoavat opiskelijoille aamiaisen ja lounaan. Myös taloudenhoitaja ja huoltotyöntekijät ovat erottamaton osa useimpia kouluja.
Koulun tason organisaation lisäksi koulun organisaatiorakenteeseen kuuluvat tyypillisesti järjestelmänvalvojat ja muu koulupiirin tasolla työskentelevä henkilöstö. Usein piirin johtaja tai esimies vastaa koko koulujärjestelmästä yhdessä muun piiritason henkilöstön kanssa. Päällikkö ja koulupiirin henkilökunta työskentelevät yleensä yhdessä koululautakunnan kanssa. Koulujärjestelmät ovat tyypillisesti osa valtion tai maakuntatason kouluryhmää, jolla on osavaltion tai provinssin päällikkö; monissa maissa on myös koulujen johtajia kansallisella tasolla. Koulun organisaatiorakenne riippuu sen sijainnista ja siitä, onko se julkinen, yksityinen vai itsenäinen.