Kello näyttää hallitsevan ihmisten elämää ja sanelevan heidän päivittäiset rytminsä. Ne nousevat tiettyyn aikaan, syövät säännöllisin väliajoin ja voivat saada sovitun nukkumaanmenoajan joka ilta. Jopa kehomme toimii eri tavalla eri vuorokaudenaikoina, ja jotkut hormonitasot nousevat esimerkiksi nukkuessamme ja verenpaine vaihtelee vuorokaudenajan mukaan. Kronoterapia toimii periaatteella, että kellon mukaan eläminen ei ole vain päivittäistä toimintaa, vaan siitä voi olla hyötyä myös tietyille terveysongelmille, kuten astmalle ja syövälle. Jotkut lääkkeet voidaan ajoittaa tehokkaammin, ja ajoitus vaikuttaa suuresti myös joihinkin mielenterveysongelmiin. Jotkut esimerkiksi kaksisuuntaisesta mielialahäiriöstä kärsivät ihmiset ovat saaneet apua kronoterapiasta, joka palauttaa kehon luonnolliset rytmit tai kehon kellot.
Kronoterapian takana on useita todistettuja periaatteita, mukaan lukien kehon oma vuorokausirytmi. Ihmisen lämpötila vaihtelee ennustettavasti koko päivän, ja naisen lämpötila nousee ovulaation aikana. Urheilusuoritusta tutkivat asiantuntijat ovat huomanneet, että lihasvoima on suurempi iltapäivällä kuin aamulla. Jopa ihmisen rintamaidossa olevat yhdisteet ovat erilaisia eri vuorokaudenaikoina. Miehiin vaikuttaa testosteronihormoni, joka löytyy heidän kehostaan aamulla korkeammalla tasolla, ja taso laskee myöhemmin päivällä.
Kronoterapia on kehon luonnollisten rytmien mukauttaminen potilaan tarvitseman hoidon kanssa, olipa kyse sitten psykiatrisista tiloista, korkeasta verenpaineesta, hormonitoimintaa tai muista lääketieteellisistä ongelmista. Kronoterapia voi myös vaikuttaa potilaan saamien lääkkeiden määrään. Joskus tietyn tyyppisten lääkkeiden pienempi annos vaaditaan, jos kehon kello on optimoitu. Jotkut lääkärit pitävät kronoterapian tarjoamasta edusta, koska he ovat nähneet potilaiden noudattavan paremmin lääkitysaikataulujaan, kun lääkkeet toimivat paremmin, ja toisinaan on myös lisäetu vähemmän epämiellyttäviä sivuvaikutuksia.
Kronoterapian rooli on näkyvin lääkehoidon alalla, ja lääkärit määräävät lääkkeitä sairauden tai tilan lisäksi myös vuorokaudenajan mukaan. Jotkut lääkemuodot ovat muuttuneet parempaan aikaan, jolloin niiden vaikuttavat aineet vapautuvat, ja niitä kutsutaan kronoterapeuttisiksi. Jotkut lääkkeet, joita käytetään syövän torjumiseen kemoterapian avulla, ovat tehokkaampia tiettyinä vuorokaudenaikoina ja niiden myrkyllisyys vähenee.