Lepakonsuojelu on termi, joka kuvaa asianomaisten henkilöiden pyrkimyksiä tukea uhanalaisia lepakoita maailmanlaajuisesti. Asiantuntijoiden mukaan lepakoita on uhattu monista syistä, kuten elinympäristön tuhoamisesta, torjunta -aineiden käytöstä ja taudeista. Lepakkojen suojelemiseksi ihmiset ovat tehneet kaikkensa lakien säätämisestä elinympäristönsä suojelemiseksi, lepakoiden populaatioon kohdistuvien uhkien tutkimiseen ja lepakoiden opettamiseen ihmisten pyrkimyksenä saada julkista tukea suojelulle.
Maailmassa on monia erilaisia lepakoita, ja monilla niistä on täysin erilainen ruokavalio, mikä johtaa hyvin erilaisiin ekosysteemirooleihin. Esimerkiksi monet lepakot toimivat pääasiassa hyönteisten saalistajina, kun taas toiset voivat syödä hedelmiä palvelemalla ekosysteemiä levittämällä siemeniä ja pitämällä metsät terveinä. Useimmissa tapauksissa asiantuntijat uskovat, että monet näistä rooleista eivät välttämättä täyty muilla eläimillä, jos lepakoiden sukupuuttoon kuolee, ja joidenkin asiantuntijoiden mielestä tällaisen tapahtuman mahdolliset seuraukset voivat olla erittäin vakavia. Huoli näistä vaaroista on yksi tärkeimmistä liikkeellepanevista voimista monien lepakoiden suojelutoimien takana.
Jotkut lepakot elävät puissa, kun taas toiset luolissa, ja suurin uhka lepakoille on yleensä elinympäristön tuhoaminen. Joskus elinympäristön tuhoaminen vahingoittaa lepakoita suoraan tuhoamalla niiden asuinpaikat, kun taas muissa tapauksissa se voi olla epäsuoria. Esimerkiksi kun ihmiset tuhoavat suot ja muut alueet, joilla hyönteisiä lisääntyy suuria määriä, hyönteiskannan väheneminen voi johtaa lepakoiden ravitsemuspulaan. Toinen ongelma on se, että jotkut luolassa asuvat lepakot elävät myös vanhojen rakennusten sisällä, ja kun nämä rakennukset puretaan, lepakot menettävät kotinsa. Joillakin alueilla on jopa hyväksytty lepakoiden suojelua koskevia lakeja, jotka asettavat rajoituksia lepakoiden suojana käyttämän rakennuksen tuhoamiselle, ja jotkut ihmiset perustavat henkilökohtaisiin kiinteistöihinsä pieniä lepakoiden suojia näiden elinympäristön menetysten korvaamiseksi.
Toinen suuri uhka lepakoille on sieni -infektio, joka tunnetaan nimellä valkoinen nenä -oireyhtymä, ja monet lepakoiden suojelutoimet on omistettu paremman käsityksen saamiseksi taudista. Valkoinen nenä -oireyhtymä johtaa sienikasvuun eri kehon alueilla, mukaan lukien suu, ja se voi aiheuttaa lepakoiden jättävän pesänsä lepotilan aikana, mikä johtaa lopulta nälkään ja kuolemaan. Jotkut asiantuntijat ajattelevat, että ihmisen luolat voivat olla ensisijaisesti vastuussa tämän sienen nopeasta leviämisestä, vaikka tämä ei välttämättä ole varmaa. Jotkut asiantuntijat ovat ehdottaneet, että ihmisten tulisi välttää luolia, kunnes tauti ymmärretään paremmin, kun taas toiset ovat yksinkertaisesti kehottaneet ihmisiä koskaan käyttämään samoja vaatteita kahteen eri luolaan.