Lonkan kysta voidaan hoitaa joko kirurgisella poistolla tai tyhjennyksellä, jota täydennetään tulehduskipulääkkeillä; paras hoitovaihtoehto riippuu suurelta osin kysta -tyypistä. Lisähoito saattaa olla tarpeen kystamuodostuksen perimmäisestä syystä riippuen. Jos kasvu kehittyy esimerkiksi fyysisen trauman seurauksena, luu on tutkittava parantumattomien vammojen varalta ennen tai jälkeen kystan poiston. Potilaat, joilla on syöpäkystat, joutuvat hoitamaan toistumisen todennäköisyyden estämiseksi. Joissakin tapauksissa kysta murtuu itsestään, eikä se edellytä lisäkäsittelyä nesteenpoiston ulkopuolella.
Hoito on yleensä tarpeetonta subkondraalisen lonkkakystan kannalta, koska tämäntyyppisellä kasvulla on taipumus poistua ajan myötä. Potilaat voivat käyttää tulehduskipulääkkeitä epämukavuuden vähentämiseksi sekä välttämään toimintoja, jotka voivat aiheuttaa painetta vaurioituneelle alueelle. Synoviaalisilla kystillä on myös taipumus kutistua ajan myötä, vaikka useimmat potilaat haluavat poistaa kasvaimet kirurgisesti estääkseen niiden kasvamisen takaisin. Tapauksissa, joissa kysta puhkeaa itsestään, potilaan on poistettava vapautunut neste alueelta. Kuten subkondraalisen lonkkaluun kysta, nivelkalvon kysta voidaan vähentää kortikosteroidien avulla.
Potilaiden tulisi myös oppia, mikä aiheutti kasvun kehittymisen, ja puuttua näihin ongelmiin. Jos sellainen muodostuu esimerkiksi osteoporoosin alkaessa, potilaan tulee tehdä tarvittavat elämäntapamuutokset, joita tarvitaan tilan hallitsemiseksi ja kasvun estämiseksi. Toisaalta potilaat, joilla on nivelreuman aiheuttamia kystat, voivat estää kystan kehittymisen reumalääkkeiden avulla. Lanteeseen vaikuttavan raskaan fyysisen aktiivisuuden vähentäminen voi myös auttaa estämään kasvua. Potilaat voivat halutessaan ottaa neula -aspiraatiokokeet saadakseen selkeämmän diagnoosin kystistään.
Lääketieteen ammattilaiset neuvovat, että potilaille tehdään lonkkakystileikkaus mahdollisimman pian, jos kasvun todetaan olevan syöpä. Tämä voi auttaa estämään syövän leviämisen koko lonkalle ja muualle kehoon, jos alue määritetään lähtökohdaksi. Erilaiset hoidot, kuten kemoterapia ja sädehoito, ovat myös toteuttamiskelpoisia ratkaisuja, jos potilas kieltäytyy leikkauksesta tai jos syöpä on alkanut muualla kehossa. Säännöllistä seurantaa on suoritettava sen varmistamiseksi, onko syöpä saatu onnistuneesti remissioon.