DNA -mikrotason analyysiä käytetään molekyylibiologiassa ja diagnostisessa lääketieteessä sen määrittämiseksi, mitkä geenit solussa kytketään päälle tiettynä ajankohtana. Tätä tekniikkaa kutsutaan multipleksimääritykseksi, koska se voi mitata tuhansia näytteitä yhdessä määrityksessä. DNA: n mikroanalyysitekniikoita käytetään tulkitsemaan RNA: lle ja DNA: lle tehtyjen määritysten tietoja kokeen erityisvaatimuksista riippuen.
DNA -mikrosarjan analyysin perusta on DNA -molekyylien korkea spesifisyys ja kyky valita DNA: n ainutlaatuisia sekvenssejä edustamaan tiettyä geeniä. Mikrotason analyysikoe suoritetaan kiinteälle pinnalle, joka on valmistettu lasi- tai silikonisirusta, jolle on asetettu kemiallinen matriisi. Matriisin pinnalla DNA- tai RNA -koettimet on järjestetty riviin.
Kun siru on asetettu tarvittavilla koettimilla, tutkittavat solut valmistellaan. Solujen valmistamiseksi ne on purettava auki, jotta niiden sisältämät nukleiinihapot voidaan eristää. Sarja reagensseja lisätään solujen sisältämien nukleiinihappojen uuttamiseksi ja väkevöimiseksi. Seuraavaksi sirulle lisätään nukleiinihappouute, joka jätetään sitten muutamaksi tunniksi, jotta koettimet voivat olla vuorovaikutuksessa ja sitoutua solunukleiinihappoihin. Lopuksi sirulle lisätään toinen sarja reagensseja paikkojen tunnistamiseksi, joissa solunukleiinihapot ovat sitoutuneet koettimiin.
Tämän jälkeen käytetään microarray -analyysiä sen määrittämiseksi, mitkä koettimet ovat pystyneet havaitsemaan solunukleiinihapot. Tämä on usein monimutkainen analyysi, koska yksi yksittäinen siru voi sisältää kymmeniä tuhansia ainutlaatuisia koettimia. Sirun anturien järjestys tallennetaan tietokoneen tietokantaan, jotta tulokset voidaan saada helposti. Sirun ja tietokannan avulla tiedemies voi laatia luettelon geeneistä, jotka ovat sitoutuneet koettimiin ja jotka olivat siksi läsnä alkuperäisessä solu -uutteessa.
Mikrotason analyysitekniikkaa käytetään yleisesti geeniekspressioprofiloinnissa. Tämäntyyppisessä kokeessa mikrokaavio perustetaan tutkimaan geenien ilmentymismalleja soluissa. Kiinnostavia geenejä koskevat koettimet sisältyvät mikrotyynyyn, ja kun koe on valmis, mikrotason tietojen analyysi voi määrittää, mitkä tutkituista geeneistä kytkettiin päälle tiettynä ajankohtana.
Muita tämän tekniikan käyttötarkoituksia ovat vertaileva genominen hybridisaatio ja SNP -havaitseminen. Vertaileva genominen hybridisaatio on testi, joka tutkii sukuelinten solujen genomipitoisuutta. Tämäntyyppinen määritys tarjoaa tietoa eri lajien välisistä geneettisistä suhteista.
SNP -havaitseminen on tekniikka, jota voidaan käyttää oikeuslääketieteellisessä analyysissä, geneettisen sidoksen analyysissä ja geneettisten sairauksien riskien arvioinnissa. SNP: t ovat yhden nukleotidin polymorfismeja, paikkoja genomissa, joissa on kaksi mahdollista emäsparisekvenssiä. SNP: t voivat tarjota joukon hyödyllisiä geneettisiä tietoja, koska eri etniset ja maantieteelliset populaatiot vaihtelevat.