Mikrobien genomi on tietyn mikrobin geneettisen koodin täydellinen sekvenssi. Mikrobien genomin koko voi vaihdella huomattavasti; organismin lopullisella koolla ei välttämättä ole vaikutusta sen geneettisen koodin kokoon. Mikrobit ovat olleet mukana erittäin pitkään, ja siksi monilla on erittäin suuret ja monimutkaiset genomit, jotka sisältävät paljon mielenkiintoista historiallista ja geneettistä tietoa.
Mikrobit, joita kutsutaan myös mikro -organismeiksi, ovat eläviä organismeja, jotka ovat niin pieniä, että ne voidaan nähdä vain mikroskoopin avulla. Joitakin esimerkkejä mikrobeista ovat vihreät levät, bakteerit, protistit, arkeat, plankton ja jotkut sienet. Nämä organismit vaihtelevat suuresti monimutkaisuudesta, äärimmäisen yksinkertaisista elävistä organismeista muihin, jotka ovat paljon monimutkaisempia. Mikrobeja löytyy kaikkialta, ja niillä on useita tärkeitä biologisia toimintoja, jotka vaihtelevat osallistumisesta orgaanisen materiaalin hajoamiseen ja taudinaiheuttajiin.
Genomi on koko joukko minkä tahansa organismin geneettistä materiaalia. Mikrobien genomin tapauksessa se koostuu täysin sekvensoidusta geneettisen informaation joukosta mikrobista. Sekvensoimalla mikrobien genomin täysin tutkijat voivat oppia paljon enemmän mikrobista ja sen toiminnasta. He voivat esimerkiksi jäljittää organismin kehityshistorian ja nähdä, missä se ja muut poikkesivat yhteisestä esi -isästä. Samoin tutkijat voivat alkaa oppia lisää joidenkin DNA -sekvenssien erityisistä toiminnoista ja selvittää, mitkä genomin osat tekevät mitä.
Bakteereilla mikrobien genomin sekvensointia vaikeuttaa se, että monet bakteerit kantavat plasmideja. Plasmidi on DNA -segmentti, jota ei kanna kromosomissa. Tämä kromosomin ulkopuolinen DNA voidaan vaihtaa bakteerien välillä, ja se voi joskus olla integroitunut mikrobien genomiin riippuen siitä, mikä organismi on osallisena ja millaisia ympäristöpaineita se kohtaa. Bakteerien genomianalyysi voi sisältää erillisen analyysin plasmidien tunnistamiseksi.
Lukuisat laboratoriot ympäri maailmaa tekevät tutkimusta mikrobien genomeista. Useat hallitukset ovat perustaneet geenisekvensointihankkeita, joiden tarkoituksena on edistää mikrobien genomien tuntemusta, osittain tavoitteena kehittää tieteellistä käyttöä mikro -organismeille. Esimerkiksi joidenkin bakteerien sekvensointi on paljastanut, että ne voivat olla hyödyllisiä ympäristön puhdistamisessa, kun taas plasmidien toiminnan ymmärtäminen on johtanut geneettisesti muokattujen plasmidien käyttöön, joita voidaan käyttää geneettisen materiaalin lisäämiseen muihin organismeihin.