Rikosteknisten analyysilaboratorioiden DNA -näytteet saapuvat joskus huonontuneina, ja testattavaa materiaalia on jäljellä vain vähän. Mitokondrioiden DNA -analyysi analysoi solun mitokondrioissa olevaa DNA: ta eikä ydin -DNA: ta, jota useimmat testit on suunniteltu. Tämä tekniikka voi tarjota todisteellisia tuloksia ja paljastaa myös sukulinjan henkilön tai lajin äitiradan kautta.
Ydin -DNA: ta löytyy vain solujen ytimestä, yksi kopio isältä ja äidiltä. Mitokondriot tuottavat energiaa soluissa ja niitä on läsnä suuria määriä. Näytteissä, joissa on heikentynyt tai puuttuva ydin -DNA, suurempi määrä mitokondrio -DNA: ta (mtDNA) tarkoittaa, että testaus voidaan silti suorittaa. Hiukset, luut ja hampaat ovat hyviä ehdokkaita mitokondrioiden DNA -analyysiin. Jos suurin osa ruumiista on hajonnut tai ehkä palanut, luut ja hampaat ovat usein jäljellä.
Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) ja Short Tandem Repeat (STR) -analyysi, yleisimmin suoritettu, vain ydin -DNA. MtDNA ei ole vain runsaampi, vaan sitä kuljetetaan myös syvemmälle soluissa, joten se ei todennäköisesti tuhoudu, kun solu vaarantuu. Se ei hajoa edes näytteen ollessa vanha. Tämä tekee mitokondrioiden DNA -analyysistä erittäin arvokkaan työkalun kylmien tapausten ratkaisemiseen.
Testit alkavat näytteen keräämisestä ja dokumentoinnista. Valokuvia otetaan, koska prosessi tuhoaa materiaalin. Kun silmämääräinen tarkastus on valmis, näyte puhdistetaan huolellisesti mahdollisten epäpuhtauksien poistamiseksi, jotka voivat vaikuttaa tuloksiin. Näyte käsitellään sitten monien kopioiden tekemiseksi DNA: sta, joita voidaan analysoida ja verrata kontrolliin.
Kaikilla äidillisesti sukulaisilla, kuten sisaruksilla, joilla on sama äiti, on täsmälleen sama mtDNA, vaikka analyysi ei pysty erottamaan yksilöitä. Sitä käytetään usein kadonneiden henkilöiden tapauksissa tai tunnistamattomien jäänteiden löytämisessä, koska elossa oleva äidin sukulainen voi osallistua vertailunäytteeseen. Mitokondrioiden DNA -analyysi voidaan suorittaa myös eläinten DNA: lla ja auttaa tutkijoita jäljittämään lajeja sukupolvien ajan.
Mitokondrioiden DNA -analyysiä on käytetty tunnistamaan Yhdysvaltojen lainvastaisen Jesse Jamesin sekä tsaari Alexandra Feodorovna Romanovan ja hänen lastensa jäänteet. Ana Anderson, nainen väittäen olevansa keisarinna tytär Anastasia, joka oli selvinnyt perheen teloituksesta, diskreditoitiin sen jälkeen, kun mtDNA osoitti hänet olevan puolalainen nimeltä Franzisca Schonzkowska. Kudoksen analyysi lapsen sydämen säilyneestä sydämestä väitettiin olevan Marie Antoinetten poika Louis Charles, joka kuoli vankilassa Ranskan vallankumouksen aikana, ja mtDNA kuningattaren hiuksista osoitti, että lapsi oli todennäköisesti onneton prinssi.