Muokattu Atkinsin ruokavalio on ruokailusuunnitelma, joka noudattaa alkuperäisen Atkinsin ruokavalion periaatteita, kuten hiilihydraattien saannin rajoittamista muutamalla muutoksella. Tyypillisesti nämä muutokset tekevät ruokavaliosta hieman terveellisempää, koska monipuolisuutta kannustetaan ja annosvalvontaa harjoitellaan usein. Lisäksi muokattu Atkinsin ruokavalio siirtää yleensä suurimman osan rasvan saannista terveellisempiin, tyydyttymättömiin lajikkeisiin. Yhtä versiota tästä ruokavaliosta käytetään myös epilepsiapotilaiden kohtausten hallintaan, ja sen on osoitettu olevan tehokas ihmisillä, jotka voivat noudattaa syömissuunnitelmaa. Potilaat saattavat mieluummin käyttää tätä ruokavaliota, koska se on vähemmän rajoittavaa kuin ketogeeninen ruokavalio, joka on usein määrätty kohtausten hallintaan, mikä helpottaa sen noudattamista.
Alkuperäisen Atkinsin ruokavalion kehitti tohtori Robert C. Atkins 1960 -luvulla, ja se perustuu pääasiassa hiilihydraattien kulutuksen ankaraan rajoittamiseen. Tämä johtuu siitä, että tohtori Atkins uskoi, että hiilihydraattien nauttimisesta johtuvat verensokerin vaihtelut aiheuttivat painonnousua. Hän suositteli, että ruokavalion seuraajat syövät niin paljon rasvaa ja proteiinia kuin haluavat, eikä vaatinut heitä rajoittamaan annoskokoja tai kalorien saantia. Tämä johti yleensä siihen, että ihmiset söivät erilaisia elintarvikkeita, joita pidetään nyt epäterveellisinä, joten ruokavaliota muutettiin 1990 -luvulla.
Muutettu Atkinsin ruokavalio pyrkii yleensä tasapainottamaan terveellisen ruokavalion alkuperäisen suunnitelman periaatteiden kanssa. Muutoksilla pyritään sallimaan seuraajien syödä tasapainoisempaa ruokavaliota. Pienet määrät hiilihydraatteja ovat sallittuja, vaikka saanti on edelleen melko rajallista verrattuna keskimääräisen yksilön tyypilliseen ruokavalioon. Toinen tärkeä muutos on, että ruokavalion seuraajia kannustetaan saamaan suurin osa rasvan saamisesta tyydyttymättömistä rasvoista, koska heillä on vähemmän kulutukseen liittyviä terveysriskejä kuin tyydyttyneillä. Osien hallintaa ja kalorien rajoituksia kannustetaan myös hillitsemään epäterveellisten elintarvikkeiden kulutusta.
Epilepsiapotilailla on osoitettu olevan jonkin verran terapeuttista hyötyä muokatun Atkinsin ruokavalion noudattamisesta. Tämän uskotaan johtuvan siitä, että ruokavalion runsas rasvankulutus mahdollistaa ketoneiksi kutsuttujen aineiden kerääntymisen potilaan järjestelmään. Ketonien esiintyminen kehossa näyttää estävän kouristusaktiivisuutta monilla potilailla, mutta ruokavaliot, jotka kannustavat heitä kerääntymään, ovat yleensä erittäin vaikeita noudattaa. Muutettu Atkinsin ruokavalio voi olla helpompaa, koska se on paljon vähemmän rajoittavaa kuin usein määrätty ketogeeninen ruokavalio. Ketogeeninen ruokavalio asettaa tiukempia rajoituksia hiilihydraateille ja kaloreille sekä rajoittaa nesteen saantia, mikä tekee sen noudattamisesta vielä vaikeampaa kuin muokattu Atkinsin ruokavalio.