Näytteen valmistelu saa materiaalin analysoitavaksi laitteilla, kuten kromatografilla, jota voidaan käyttää yhdisteen sisällön määrittämiseen. Raakanäytteitä ei yleensä voida lisätä suoraan tieteellisiin laitteisiin, koska ne sisältävät epäpuhtauksia tai ovat muodossa, jota laite ei pysty helposti tulkitsemaan. Niitä on käsiteltävä huolellisesti ja valmisteltava, jotta ne ovat valmiita testaukseen, valvotuissa olosuhteissa virheiden mahdollisuuden rajoittamiseksi. Käytettävissä on useita erilaisia tekniikoita käytettäväksi erilaisten näytteiden kanssa.
Teknikot aloittavat raakanäytteestä, jonka he ovat mahdollisesti keränneet tai vastaanottaneet analysoitavaksi. He päättävät, mitä näytteen valmistustekniikkaa käytetään arvioidessaan materiaalin luonteen ja päättäessään, millaista testausta he haluavat käyttää. Näyte on ehkä keskitettävä, koska kiinnostuksen kohteena oleva materiaali on laimennettu voimakkaasti, tai sitä on käsiteltävä epäpuhtauksien poistamiseksi, jotka voivat häiritä testausta. Näytteen valmistelu voi sisältää suodatuksen, liuottamisen, jauhamisen ja muita toimintoja näytteen muuntamiseksi laitteeseen luettavaan muotoon.
Teknikko voi esimerkiksi haluta käyttää alinäytteenottoa näytteen valmistelussa. Tämä mahdollistaa alkuperäisen näytteen pienen komponentin testaamisen sen säilyttämiseksi, jotta sitä voidaan käyttää toistuvissa tai eri testeissä. On tärkeää saada edustava näyte virheellisten tulosten välttämiseksi, joten näytettä on käsiteltävä huolellisesti, jotta saadaan hyvä osa-näyte analysointia varten.
Työolosuhteita on valvottava huolellisesti näytteen valmistelussa. Kaikki näytteeseen lisätyt asiat on tiedettävä, jotta teknikko välttää vahingossa tapahtuvan kontaminaation. Jos esimerkiksi kemikaali on altistettava kemialliselle reaktiolle, jotta se voidaan lukea tieteellisessä instrumentissa, teknikon on käytettävä oikeaa reaktiivista ainetta. Kaikkien käytettyjen astioiden ja laitteiden on oltava puhtaita ja penkkiympäristön on oltava puhdas, jotta vältetään astioiden ja menetelmien sekoittaminen.
Yksittäisillä laboratorioilla voi olla oma näytteenvalmistusprotokolla. Laboratorion käsikirjassa keskustellaan käytettävissä olevista tekniikoista ja annetaan suosituksia tiettyjen kiinnostavien materiaalien käsittelystä. Tämä dokumentaatio voi lisätä testauksen johdonmukaisuutta ja varmistaa, että riippumatta siitä, kuka teknikko suorittaa testin, näyte käsitellään samalla tavalla. Laboratorion asiakkaat voivat pyytää asiakirjoja varmistaakseen, että testit suoritetaan asianmukaisesti. Esimerkiksi laboratorion, joka testaa urheilijoiden näytteitä dopingin tarkistamiseksi, tulisi tehdä se hallintoelimen suositusten mukaisesti, jotta sen tulokset ovat päteviä.