Organisaatiorakenne on kehys, jonka avulla yrityksen tai organisaation työntekijöitä valvotaan ja tehtävät jaetaan. Vaikka tällaisella järjestyksellä on laajoja vaikutuksia organisaation yleiseen tapaan saavuttaa tavoitteensa, se vaikuttaa myös voimakkaasti tiettyjen hankkeiden hallintaan. Organisaatiorakenteen rooli projektinhallinnassa on tärkeä, koska organisaation valvonta- ja tehtävienjakorakenteet vaikuttavat suoraan odotuksiin, itsenäisyyden tasoon ja joustavuuteen, joka on sallittu tietyissä projekteissa työskenteleville ihmisille tai ryhmille. Organisaatiorakenne voi myös vaikuttaa tapaan, jolla eri projektin parissa työskentelevät ryhmät ovat vuorovaikutuksessa keskenään ja kuinka rajalliset hankeresurssit jaetaan.
Monet organisaatiot on rakennettu tiukasti hierarkiseen tapaan, mikä tarkoittaa, että on olemassa jäykästi määritelty valtarakenne, jossa esimiehet tekevät päätöksiä, jotka ohjaavat heidän alaistensa toimintaa. Hierarkinen organisaatiorakenne takaa yleensä projektinhallinnan vakauden ja tehokkuuden. Esimiehet tekevät tärkeimmät päätökset hankkeen kulusta, aikataulusta sekä tehtävien ja resurssien jakamisesta, ja heidän alaisensa suorittavat tehtävät hyvin vähän tai ei lainkaan. Tämäntyyppinen organisaatiorakenne voi johtaa projektin nopeaan loppuunsaattamiseen ja tehokkaaseen resurssien käyttöön.
Muut organisaatiorakenteet, vaikka ne ovat yleisesti ottaen edelleen hierarkkisia, mahdollistavat suuren itsenäisyyden projektinhallinnassa. Tämän projektinhallinnan organisaatiorakenteen tarkoituksena on antaa enemmän mahdollisuuksia luovuudelle ja innovoinnille. Projektit viimeistelevät usein pienet, itsenäiset “tiimit”, joilla on oma organisaatiorakenne. Vaikka tiimien tai itsenäisten henkilöiden odotetaan raportoivan edistymisestään esimiehille, heidän ei usein tarvitse noudattaa tiukkaa aikataulua ja he voivat suurelta osin itse päättää parhaan tavan toteuttaa projekti. Tämäntyyppinen rakenne johtaa usein projektin hitaampaan valmistumiseen ja resurssien vähemmän tehokkaaseen käyttöön, mutta se edistää innovaatioita, jotka voivat parantaa huomattavasti tietyn hankkeen arvoa.
Organisaatiorakenne voi vaikuttaa projektinhallintaan muutamalla muulla tavalla. Joissakin tapauksissa esimerkiksi organisaation rakenne sisältää perusteellisia koulutusohjelmia, jotka voivat parantaa johtajien ja työntekijöiden kykyä suorittaa tietyntyyppisiä projekteja. Jotkut rakenteet virtaviivaistavat projektinhallintaprojektia ja johtavat tehokkaaseen resurssien käyttöön ja osaaviin työntekijöihin. Toiset, erityisesti liian monimutkaiset rakenteet, voivat yksinkertaisesti vaikeuttaa projektinhallintaa ja johtaa läpipääsemättömiin byrokraattisiin esteisiin hankkeiden hallinnoinnissa ja toteuttamisessa.