Patogeeniset bakteerit ovat bakteereja, jotka voivat aiheuttaa sairauksia. Ihmiset ovat yleensä eniten kiinnostuneita bakteereista, jotka voivat aiheuttaa sairauksia ihmisille, vaikka nämä bakteerit voivat tartuttaa myös muita eläimiä ja kasveja. Joitakin merkittäviä patogeenisiä bakteereja ovat muun muassa Streptococcus, Staphylococcus, Tuberculosis ja Escherichia coli. Nämä bakteerit aiheuttavat maailmanlaajuisesti monia sairauksia ja tautiepidemiaa.
Solunsisäiset bakteerit ovat patogeenisiä bakteereja, jotka aiheuttavat aina sairauksia ihmiskehoon päästessään, toisin kuin ehdolliset bakteerit, jotka voivat aiheuttaa infektioita ja sairauksia tietyissä olosuhteissa. Monet bakteerit ovat ehdollisia ja hyödyntävät sattumaa kuten avointa haavaa monistamaan itsensä ja levittämään tautia. Opportunistiset bakteerit ovat bakteereja, jotka eivät yleensä aiheuta sairautta, mutta jos potilaan immuunijärjestelmä on heikentynyt.
Monet ihmiset isännöivät itse asiassa suuria määriä bakteereja milloin tahansa. Nämä bakteerit tunnetaan kommensali- tai ”hyvinä” bakteereina, koska ne suorittavat joitakin elintärkeitä ja hyödyllisiä toimintoja ihmiskehossa. Esimerkiksi suolistossa olevat Commensal -bakteerit auttavat hajottamaan ja sulattamaan ruokaa.
Patogeeniset bakteerit voivat levitä ihmispopulaation kautta monin eri tavoin. Ilma, vesi ja maaperä ovat kaikki yleisiä vektoreita, ja ihmiset voivat myös siirtää bakteereja suoraan toisilleen fyysisen kosketuksen kautta. Jotkut bakteerit ovat erittäin taitavia asuttamaan paikkoja, kuten ovenkahvat ja lääketieteelliset laitteet, jolloin ne voivat liikkua helposti henkilöstä toiseen, kun taas toiset ovat paljon vähemmän virulentteja ja kuolevat, jos he ovat poissa ihmisen isännältä liian kauan.
Tuberkuloosi on yksi maailman johtavista tappajista, joten se on erityisen kiinnostava patogeeninen bakteeri. Patogeeniset bakteerit ovat myös vastuussa suolisto -ongelmista, kuten kroonisesta ripulista, ja ne voivat aiheuttaa infektioita monissa kehon osissa. Jotkut ovat tappavia, kuten Legionella -bakteeri, kun taas toiset ovat suhteellisen hyvänlaatuisia, varsinkin jos hoitoon pääsee. Yksi suurimmista kehitysmaiden ongelmista on hoidettavien bakteeri -infektioiden leviäminen, jotka kulkevat hallitsemattomasti läpi väestön, koska lääkkeitä ja hoitoa ei ole saatavilla.
Patogeenisen bakteerin aiheuttaman infektion hoitoon kuuluu antibioottien käyttö, lääkkeet, jotka on erityisesti suunniteltu tappamaan bakteereja. Joillekin bakteereille on kehittynyt antibioottiresistenssi, mikä tarkoittaa, että ne eivät ehkä reagoi moniin tavallisiin antibiooteihin. Tämä pakottaa lääkeyhtiöt tutkimaan uusia antibiootteja, jotta ne voivat pysyä bakteerimutaatioiden edellä.