Patogeneesi on sairauden kehittyminen taudin alkamisesta aina sen loppuvaiheisiin. Patogeneesin tutkimus on tärkeää lääketieteen ammattilaisille, koska se auttaa heitä tunnistamaan ja hoitamaan sairauksia. Se on myös osa laboratoriotieteiden työtä, joka työskentelee sairauksien parantamisen ja hoidon parissa, koska jokainen kehitysvaihe edustaa mahdollista mahdollisuutta keskeyttää taudin eteneminen.
Termi “patogeneesi” tulee kreikan sanoista “sairaus” ja “alku”. Taudin alkuperät ovat ensimmäinen askel patogeneesissä, samoin kuin progressiiviset muutokset, joita tapahtuu kehossa, kun tauti tarttuu ja alkaa vaikuttaa kehoon. Esimerkiksi jos joku leikataan ja haava on kolonisoitu Staphylococcus -bakteereilla, bakteerit aiheuttavat tulehdusta, kun ne alkavat levitä ja johtavat lopulta infektioon. Jokainen vaihe leikkauksesta täydelliseen infektioon on osa kehitystä.
Patogeneesin tutkimuksessa on useita käyttötarkoituksia. Yksittäisten potilaiden tapauksessa se antaa lääkärille mahdollisuuden päättää, mikä aiheutti sairauden ja miten tautia voidaan hoitaa. Taudin saavuttamisen vaiheen tunnistaminen voi olla tärkeää myös lääketieteellistä hoitoa tarjoavalle lääkärille, kuten onkologin tapauksessa, joka haluaa määrittää syövän vakavuuden.
Taudin kehityksen tutkiminen voi myös antaa tietoa sairauksien leviämistavoista ja mahdollisesti edistää sellaisen ohjelman kehittämistä, joka on suunniteltu hidastamaan tautien leviämistä. Esimerkiksi yllä olevassa esimerkissä tartunnan saaneesta leikkauksesta infektio olisi voitu estää puhdistamalla haava säännöllisesti antibakteerisella saippualla. Menetelmää käytetään laajalti kodeissa ja sairaaloissa ympäri maailmaa infektioriskin vähentämiseksi. Tämä ala on myös kriittinen osa uusien ja nousevien sairauksien tutkimista, koska näitä sairauksia ei voida tehokkaasti torjua ymmärtämättä, mistä ne ovat peräisin.
Useat lääketieteen alat risteävät patogeneesin kanssa, mukaan lukien patofysiologia, taudin etenemisen kehossa aiheuttamien muutosten tutkimus ja epidemiologia, tutkimus siitä, miten tauti kehittyy ja liikkuu populaatioissa. Taudin kehittymisen tutkiminen on erityisen tärkeää lääkäreille, koska sen avulla he voivat ryhtyä toimiin monenlaisten sairauksien ehkäisemiseksi, diagnosoimiseksi ja hoitamiseksi. Monet maallikot tuntevat myös patogeneesin jossain määrin, kuten ihmisten kohdalla, jotka tuntevat toistuvien poskiontelotulehdusten etenemisen, tai ihmiset, jotka pesevät kätensä vähentääkseen altistumista tauteja aiheuttaville aineille.