Mikä on prokaryoottinen transkriptio?

Toisin kuin eukaryoottisolut, prokaryoottisoluilla, kuten bakteereilla, ei yleensä ole yksittäisiä rakenteita, joita kutsutaan organelleiksi. Tyypillisesti ei ole ydintä, mitokondrioita tai muita alueita, joilla esiintyy erillisiä aineenvaihduntaprosesseja; kaikki on enimmäkseen vapaasti kelluvaa soluseinän ja plasmakalvon sisällä. Kuten eukaryoottisolut, on yleensä deoksiribonukleiinihapon (DNA) ja ribonukleiinihapon (RNA) säikeitä, jotka voidaan kopioida transkription avulla. Prokaryoottista transkriptiota kontrolloi tyypillisesti entsyymi nimeltä prokaryoottinen RNA -polymeraasi, jonka on aloitettava DNA: n transkriptio, kun taas prosessin lopettaminen laukaistaan ​​yleensä muiden nukleotidisekvenssien avulla.

Kun RNA -polymeraasientsyymi kulkee DNA -juosteen pituuden, se purkaa sen transkriptiokohdasta ja lähetin, siirto ja ribosomaalinen RNA voidaan tehdä. Prokaryoottisessa transkriptiossa on tyypillisesti kahdenlaisia ​​entsyymejä; yksi on ydinentsyymi, joka voi tehdä kopioita, mutta ei löydä sopivaa kohtaa geenistä. Molekyylin holoentsyymimuoto pystyy usein käynnistämään transkription tietyllä alueella, ja siksi se on suunniteltu paikantamaan promoottorisekvenssit, jotka kertovat molekyylille, milloin aloittaa DNA: n kopiointi. Holoentsyymi suorittaa tämän toiminnon komponentin, jota kutsutaan sigmaksi, kautta.

Prokaryoottinen transkriptio alkaa, kun RNA -polymeraasi kiinnittyy DNA -promoottorikohtaan. Molekyyli ja kaksijuosteinen rakenne, jota kutsutaan suljetuksi kompleksiksi, voivat sitten olla vuorovaikutuksessa ja DNA avataan yksijuosteiseksi sekvenssiksi lähelle transkription alkua. Tätä kutsutaan avoimeksi kompleksiksi. Entsyymi aloittaa tyypillisesti transkriptioprosessin luomalla noin 10 käyttökelvotonta transkriptiota, joita proteiini estää poistumasta kompleksista.

Kun tämä proteiini vapautuu, entsyymi jatkaa transkriptiota. Joskus on eroja siinä, kuinka voimakkaasti RNA -polymeraasi ja proteiinit sitoutuvat DNA: han; Tämän sidoksen vahvuus voi liittyä tilastolliseen todennäköisyyteen, että tietty perusta on tietyssä paikassa. Kuinka läheisesti emäkset vastaavat tätä konsensussekvenssiä, määrää usein, kuinka vahva sidos tulee olemaan.

RNA: n prokaryoottinen transkriptio tapahtuu yleensä noin 40 nukleotidia sekunnissa. Jotkut proteiinit voivat muuttaa nopeutta, jolla tämä tapahtuu, ja myös tiettyjen sekvenssien kopioinnin nopeus voi olla erilainen. Säätimen geenit muuttavat usein sekvenssien ilmentymistä sen mukaan, mitä solu tarvitsee. Prokaryoottinen transkriptio voidaan lopettaa joko silloin, kun RNA: n sekvenssit aiheuttavat molekyylikompleksin ja DNA: n erottumisen tai kun tietty proteiini sitoutuu RNA -polymeraasientsyymiin ja kulkee siihen asti.