Proteiini S: n puutos on yleensä perinnöllinen, vaikka se voidaan myös hankkia, häiriö, joka vaikuttaa kehon kykyyn estää veren hyytymistä epänormaaleissa kuvioissa. Tämä on hyvin harvinainen sairaus, joka on hoitamaton ja voi olla erittäin vaarallinen. Se voi johtaa siihen, että ihmisillä on huomattavasti suurempi riski saada tromboosi tai verihyytymä. Tämä puolestaan lisää aivohalvauksen ja sellaisten tilojen riskiä kuin keuhkoembolia (keuhkovaltimon tukos). Tauti on usein hallittavissa, kun se diagnosoidaan, mutta se on harvinaista eikä sitä voida diagnosoida ennen ensimmäistä verihyytymetapausta, ellei taudin sukututkimus ole hyvin ilmeinen ja selvästi tiedossa.
On olemassa useita erilaisia proteiini S -vajeita, jotka voivat vaikuttaa tilan ilmaantumiseen. Näitä kutsutaan tyypeiksi I, II ja III tai vuorotellen tyypeiksi I, IIa ja IIb. Proteiini S: llä, joka auttaa proteiini C: n työtä, on kehossa kaksi erilaista muotoa, joita kutsutaan vapaiksi ja sitoutuneiksi muodoiksi; tauti ilmaistaan lähinnä sen vuoksi, mitä vapaat muodot kykenevät tekemään. Esimerkiksi tyypissä I vapaa S ei ole riittävän suuria määriä auttamaan C: tä, tyypissä II vapaa S ei ole rakennettu oikein eikä voi tehdä tehtäväänsä lainkaan, ja tyypin III vapaa S -määrä on liian pieni . Ero tyypin I ja III välillä on se, että tyypin I sidottu S on myös liian alhainen, mutta sitä on saatavana normaalina määränä tyypissä III.
Kuten aiemmin todettiin, proteiini S: n puutos on harvinaista, ja sitä ei ehkä ajatella etsimään, ellei jotkut olosuhteet, kuten veren hyytyminen, alkavat usein sairauksien, kuten syvä laskimotukoksen (DVT), muodossa. Ensimmäiset oireet voivat olla verihyytymä, joka voi ilmetä jo 20 -luvulla. Sitä ennen ihmisillä ei ehkä ole oireita ollenkaan, eivätkä he välttämättä huomaa mitään erilaista.
Kun proteiini S: n puutos on diagnosoitu, hoitokurssi on yleensä hyvin selvä. Useimmat ihmiset käyttävät hyytymistä estäviä lääkkeitä. Ilmeinen valinta tähän on varfariini (Coumadin®). Varfariinipitoisuuksia on hallittava huolellisesti. Muut lääkkeet voivat olla sopivampia raskauden aikana, yleinen aika, jolloin tämä tila saatetaan diagnosoida. On naisia, joilla on tämä ehto ja jotka voivat taitavasti hallita lapsia, vaikka riski voi olla suurentunut.
Vaikka tämä ehto voi olla yleisimpiä perinnöllisessä muodossa, ihmiset voivat saada tämän puutteen johtuen eri tekijöistä. Varfariini, juuri hyytymisen estämiseen käytettävä lääke, aiheuttaa joskus alempia proteiini S -tasoja. Raskaus, ehkäisypillerit ja estrogeenihoito laskevat myös S -tasoja. Perinnöllisellä puolella on vakava proteiini S -vaje, joka voi ilmetä, kun ihmiset perivät vanhemmiltaan kaksi viallista proteiini S -geeniä. Tämä voi aiheuttaa Purpura fulminans -nimisen sairauden, joka on helppo diagnosoida vastasyntyneellä, koska se aiheuttaa vauvoille vakavan sairauden ja johtaa kuolemaan ilman välitöntä hoitoa.