Proteiinielektroforeesi on lääketieteellinen toimenpide, jota käytetään nestenäytteessä olevien proteiinien erottamiseen ja analysointiin. Testattava näyte on yleensä virtsa- tai verinäyte. Aivo -selkäydinneste voidaan myös testata käyttämällä tätä tekniikkaa.
Proteiinimolekyylien erottaminen elektroforeesissa suoritetaan sähkövarauksella. Ensinnäkin proteiinimolekyylejä käsitellään antamaan niille negatiivinen magneettinen varaus. Sitten näyte asetetaan alustalle tai tavallisesti jonkinlaisen geelin päälle, johon sähkökenttä kohdistetaan. Ennen elektroforeesigeelien keksimistä varhaisissa proteiinielektroforeesitekniikoissa käytettiin substraattina erityyppistä paperia.
Proteiinimolekyylien varauksen vuoksi ne siirtyvät vähitellen kohti sähkökentän positiivista puolta. Proteiinimolekyylit erotetaan koon mukaan, koska pienemmät molekyylit kulkevat nopeammin kuin suuret. Yleensä tarvitaan väriainetta, jotta proteiinit näkyvät.
Seerumiproteiinielektroforeesi on spesifinen elektroforeesitesti, jota käytetään tunnistamaan proteiinit, nimeltään globuliinit, joita esiintyy veriseerumissa. Jotkut häiriöt, jotka voidaan diagnosoida tämän testin avulla, ovat kirroosi, maksasairaus, anemia ja useita erilaisia syöpiä. Esimerkiksi alhainen proteiinipitoisuus, jota kutsutaan albumiiniksi, voi viitata maksasairauteen. Haptoglobiini ja makroglobuliini ovat kaksi proteiinia, jotka osoittavat usein alentuneita tasoja tietyntyyppisissä anemioissa.
Normaali virtsa sisältää erittäin vähän proteiineja. Virtsan proteiinielektroforeesi suoritetaan yleensä sen jälkeen, kun lääkäri on diagnosoinut kohonneet proteiinipitoisuudet potilaan virtsassa. Esimerkki proteiinista, jota esiintyy usein kohonneina määrinä virtsassa, kun potilaalla on munuaisongelma, on Bence Jones -proteiini. Erilaisten virtsassa olevien proteiinien geelielektroforeesi voi auttaa tunnistamaan erityisiä munuaissairauksia, jotka voivat aiheuttaa proteiinien erittymisen. Koska virtsassa ja aivo -selkäydinnesteessä on yleensä paljon pienempi proteiinipitoisuus kuin veriseerumissa, tarvitaan yleensä pitoisuusmenettely ennen proteiinigeelielektroforeesin suorittamista virtsasta tai aivo -selkäydinnesteestä.
Sen lisäksi, että proteiinielektroforeesi on tärkeä käyttö diagnooseissa, sitä käytetään usein jatkuvien olosuhteiden seurantaan. Hoidettavasta häiriöstä viittaavan proteiinipitoisuuden mittaaminen voi olla tärkeä tapa määrittää taudin eteneminen ja mitata määrätyn lääkkeen tai hoidon onnistumista tai epäonnistumista. Tällaista seurantaa käytetään tyypillisesti etenevissä munuais- ja maksasairauksissa ja joissakin autoimmuunisairauksissa.