Pseudomonas putida on eräänlainen gram-negatiivinen bakteeri, jota esiintyy yleisesti vedessä ja maaperässä, erityisesti kasvien juurien ympärillä. Se voi suojata kasveja muiden mikro -organismien taudeilta. Sen aineenvaihdunta on hyvin monimutkaista, ja bakteerit voivat hajottaa monenlaisia orgaanisia epäpuhtauksia. On kaupallista kiinnostusta käyttää sitä tähän tarkoitukseen. Normaalisti bakteereja pidetään turvallisina, mutta on muutamia tapauksia, joissa ne ovat aiheuttaneet sairauksia ihmisillä, joilla on heikentynyt immuunijärjestelmä.
Saasteiden, joita aiemmin pidettiin biologisesti hajoamattomina, kuten Styrofoam ™, on tämän jälkeen havaittu hajottavan tämän organismin. Näiden bakteerien biologisten ja kemiallisten sovellusten vuoksi useiden kantojen DNA -sekvenssit on sekvensoitu. Ne liittyvät läheisesti Pseudomonas aeruginosaan, joka on ihmisten opportunistinen taudinaiheuttaja. Sekvensoinnin avulla havaittiin, että Pseudomonas putidasta puuttui avaingeenejä, joita Pseudomonas aeruginosa käyttää aiheuttamaan sairauksia ihmisillä. Se ei esimerkiksi voi hajottaa solukalvoja tai vapauttaa toksiineja.
Niissä harvoissa tapauksissa, joissa Pseudomonas putida on todettu patogeeniseksi ihmisillä, se oli jo sairaiden ihmisten joukossa. Toinen yhteinen piirre oli, että bakteerit levitettiin johonkin, jonka piti olla steriili. Esimerkiksi yhdessä tapauksessa huurtumista estävä liuos oli saastunut bakteereilla. Toisissa ihmisissä, jotka olivat äskettäin ottaneet antibiootteja, asetettiin steriilejä katetreja tai vastaavia laitteita.
Kerran kehossa oleva Pseudomonas putida voi aiheuttaa systeemisiä infektioita, kuten bakteereja – veren tulehduksia. Keuhkokuume tai peritoniitti ovat vakavia sairauksia, jotka voivat johtua tästä bakteerista. Se voi myös aiheuttaa enemmän paikallisia infektioita, kuten sinuiitti tai virtsatieinfektiot.
Yleensä Pseudomonas putida on nimetty turvalliseksi bakteeriksi käytettäväksi geenien kloonauksessa bioremediaatiotöitä varten. Tähän liittyy organismin systeeminen käyttö epäpuhtauksien hajottamiseksi vedessä tai maaperässä. Näillä bakteereilla on erittäin monipuolinen aineenvaihdunta ja ne voivat hajottaa joukon myrkyllisiä kemikaaleja, mukaan lukien bensiinikomponentit. Muut kannat voivat muuttaa pakkausmaapähkinöitä, jotka on valmistettu polystyreenivaahdosta, biohajoavaksi muoviksi. Tämän organismin hajoavia kykyjä tutkitaan paljon.
Pseudomonas putida on myös tärkeä kasvien terveyden ylläpitämisessä. Se elää useimmilla maaperillä ja liittyy kasvien juuriin, missä se parantaa usein kasvien terveyttä. Organismi tuottaa myös molekyylejä, jotka sitovat rautaa kasvin ympäriltä. Tämä vie sieniltä ja muilta bakteereilta tarvittavan ravintoaineen ja rajoittaa niiden kasvua. Näin se voi vaikuttaa joidenkin kasvien patogeenien biologiseen valvontaan.
Pseudomonas putidaa käytetään geenitekniikkaan monilla tutkimusalueilla. Yhdistelmäbakteereja tuotetaan tiettyjen epäpuhtauksien hajottamiseksi ja biopestisidien toimittamiseksi kasvien juurille. Niitä käytetään myös ilmentämään Pseudomonas aeruginosa -geenejä, jotka voivat olla mukana ihmisten sairauksien aiheuttamisessa. Tutkijat mieluummin suorittavat tällaisia kokeita Pseudomonas putidalla, koska on erittäin epätodennäköistä, että ne aiheuttavat sairauksia ihmisillä verrattuna Pseudomonas aeruginosaan.