RNA -promoottori on nukleotidisekvenssi, joka edeltää ribonukleiinihappoa (RNA) koodaavaa geeniä. Tämä sekvenssi sijaitsee solun deoksiribonukleiinihapossa (DNA), ja kuten kaikki promoottorit, RNA -promoottori auttaa helpottamaan geenin transkriptiota. Ero tämän tyyppisten promoottoreiden ja muiden promoottorityyppien välillä on se, että vaikka monet promoottoria seuraavat geenit koodaavat muistin RNA: ta (mRNA), geenit, jotka seuraavat ribosomaalisen RNA: n (rRNA) RNA -promoottorikoodia, joita käytetään ribosomeissa mRNA: n kääntämisessä proteiineja. RNA -promoottoreita löytyy kaikkien eukaryoottisolujen geneettisistä tiedoista, joten niitä on kaikilla organismeilla paitsi bakteereilla ja viruksilla. Tämä promoottori voidaan tunnistaa proteiineista, jotka sitoutuvat sekä sen nukleotidisekvenssiin että transkriptiosta vastaavaan entsyymiin nopeuttaen transkription nopeutta.
RNA -promoottori hoitaa tehtävänsä tarjoamalla sitoutumiskohdan RNA -polymeraasi I: lle, entsyymille, joka transkriboi rRNA: ta, sekä niihin liittyville transkriptiotekijöille. DNA: n promoottorisekvenssi on erilainen kuin useimmat geenit, jotka käyttävät tymiini- ja adeniinisarjaa nukleotideja, joita kutsutaan TATA -laatikoiksi. RNA -promoottorilla on sen sijaan sekvenssi, jota kutsutaan ylävirran säätelysekvenssiksi (UCS), joka tunnistetaan proteiinilla, jota kutsutaan upstream -sitoutumistekijäksi (UBF). Kun ne ovat sitoutuneet, suurempi proteiinikompleksi, nimeltään transkription aloitustekijä-IB (TIF-IB). TIF-IB koostuu TATA: ta sitovasta proteiinista (TBP), jota käytetään muissa promoottoreissa, sekä muista transkriptiotekijäentsyymeistä. Muut läsnä olevat entsyymit auttavat TBP: tä sitoutumaan UBF: ään, koska kuten edellä mainittiin, DNA: n rRNA: ta koodaavissa sekvensseissä ei ole TATA -laatikkoa, johon se voi sitoutua.
Kun TIF-IB-kompleksi on sidottu ylävirtaan rRNA: ta koodaavasta geenistä, se fosforyloituu, mikä aktivoi kompleksin ja sallii sen rekrytoida ja sitoa RNA-polymeraasi I: n. Tämä on ainoa entsyymi, joka kykenee transkriptoimaan rRNA: ta koodaavan DNA-sekvenssin ja sellaisenaan ainoa polymeraasityyppi, joka käyttää RNA -promoottoria. Se sitoutuu promoottorikompleksin osaan, joka koostuu proteiiniin TBP: hen liittyvästä tekijä-IA: sta, ja voi sitten vuorostaan sitoutua rRNA: ta koodaavan promoottorikompleksin alavirtaan olevaan DNA-sekvenssiin. Tämän promoottorin kautta RNA -polymeraasi I voi löytää tarvittavat DNA -sekvenssit transkriptioon paljon nopeammin kuin jos sen olisi löydettävä nämä sekvenssit yksinään, joten tämä promoottori on keino säätää rRNA: n transkriptionopeutta.