RNA -sekvensointi on prosessi nukleotidisekvenssin määrittämiseksi ribonukleiinihapon tai RNA: n juosteessa. RNA koostuu neljästä nukleotidista, joita kutsutaan adeniiniksi (A), guaniiniksi (G), sytosiiniksi (S) ja urasiiliksi (S). Nukleotidien erityinen sekvenssi on “koodi”, joka sisältää geneettistä tietoa, jota käytetään erityyppisten proteiinien tuottamiseen tai jonkin tietyn toiminnon palvelemiseen yksinään. Geneettiset koodit nukleotidisekvenssien muodossa määrittelevät lähes kaikki biologiset prosessit, joihin liittyy organismin kehitys ja toiminta. RNA -sekvensointi on siis eräänlainen tutkimus, jonka tarkoituksena on selvittää kyseisen geneettisen koodin tarkka luonne ja yhdistää koodi tiettyihin rakenteisiin ja toimintoihin organismin sisällä.
Tutkijat sekvensoivat deoksiribonukleiinihappoa tai DNA: ta paljon useammin kuin RNA: ta. DNA koostuu samoin nukleotideista, mutta ne on järjestetty kaksoiskierreksi. RNA -transkriptiot tehdään itse asiassa DNA -juosteen nukleotidisekvenssin perusteella – DNA pyrkii olemaan vahvempi kuin RNA, koska monet RNA -juosteet on tehtävä yhdestä DNA -sekvenssistä. Lisäksi DNA sisältää “introneja” tai ei -koodaavia DNA -segmenttejä, joita muokataan transkriptioprosessin aikana ja joita ei siksi havaita RNA -sekvensoinnilla. RNA-sekvensointi on edelleen tärkeä, vaikka monissa tapauksissa on välttämätöntä ensin “käänteiskopioida” RNA takaisin DNA: han ennen sen sekvensointia.
Se, että RNA -sekvenssi ei välttämättä ole sama kuin DNA -sekvenssi, josta se transkriboitiin, on yksi tärkeimmistä syistä siihen, miksi tutkijat todella suorittavat RNA -sekvensointikokeita. RNA -sekvensoinnin avulla tutkijat voivat löytää, mitkä DNA -mallin osat on muokattu transkription aikana. Tietäessään tämän he voivat sitten tutkia, miten ja miksi sekvenssi on muokattu. Yksi mielenkiintoisista biologian ongelmista on se, että suuri osa genomista eli geneettisen tiedon yhdistäminen organismin sisällä näyttää olevan käyttämättä. Oppiminen tarkalleen mitä sekvenssejä käytetään ja mitkä eivät ole tärkeä askel tutkittaessa näiden käyttämättömien geneettisen informaation osien monimutkaisuutta.
Tehokkaampien RNA -sekvensointimenetelmien kehittäminen on monien biotekniikan tutkijoiden tärkeä painopiste. Tutkijoiden on yleensä käänteistranskriptoitava RNA DNA: ksi ennen sekvenssin ottamista. Tutkijat haluavat kehittää menetelmiä, jotka mahdollistavat RNA: n tehokkaan suoran sekvensoinnin vahingoittamatta RNA -juosteita. Lisäksi tutkijat haluavat löytää suuren suorituskyvyn menetelmiä, joiden avulla he voivat sekvensoida monia RNA-juosteita yhden RNA-sekvensointiprosessin aikana.