Seepran elinympäristön ominaisuudet vaihtelevat seepralajeittain. Seepraa on kolme lajia: Grevy’s, Mountain ja Burchell’s (tunnetaan myös nimellä Plains). Grevyn seepra asuu elinympäristössä, johon kuuluu niityt ja savannit. Vuori seeprat elävät rinteillä ja tasangoilla, kuten nimestä käy ilmi. Burchellin tai Plainsin seeprat asuvat savannilla, lyhyillä niityillä, korkeilla nurmikoilla ja avoimilla metsillä.
Grevyn seeprat ovat suurempia kuin tasangot. Heillä on kapeampia mustia raitoja, suuret pyöreät korvat ja valkoinen vatsa. Pääasiassa Pohjois -Keniassa ja Etelä -Kaakkois -Etiopiassa tämä seepralaji asuu savannilla ja niityillä.
Tavalliset seepratakit voivat vaihdella raitojen lukumäärän ja koon mukaan, ja harja on lyhyt, pystyssä oleva karva, jossa on kimppu hännässä. Pohjois -Kenia on Plainsin seeprajen yleisin paikka. Tasankojen seepra -elinympäristö koostuu savannista, lyhyistä nurmikoista, korkeista nurmikoista ja avoimista metsistä.
Ruoho korkeilla niityillä voi nousta 5 metrin korkeuteen ja tyypillisesti sataa 1.5 tuumaa (30 cm) vuodessa. Toisin kuin korkeilla nurmikoilla, lyhyillä niityillä on lyhyt ruoho, jossa sataa vain noin 76.2 tuumaa (10 cm) vuodessa, mikä tyypillisesti pysäyttää kasvun. Molempien yhdistelmänä sekoitetut nurmet kasvavat noin 25.4-2 metrin korkeudella ja saavat lähes 3 tuumaa (0.6-0.9 cm) sadetta vuodessa.
Savannat ovat myös yleisiä elinympäristöjä Grevy’s- ja Plains -seepraille. Ruoho kattaa suurimman osan alueesta, kun taas puut ovat laajalti. Puiden peite on vain 5–30% alueesta. Sade riittää kasvamaan ruohoa, mutta ei metsiä. Kuivuuskaudet ovat käynnissä, mikä aiheuttaa satunnaisia tulipaloja ja leviää.
Avoin metsä on ainoa seepra -elinympäristö, jota Grevy ja Plains eivät jaa. Tämä on avointa metsämaata, jossa on vähän puita. Paljon auringonvaloa paistaa läpi, mutta varjoa ei juuri ole. Ruohoa, pensaita ja nurmikasveja on runsaasti.