Sinkkisormi on sormenmuotoinen proteiinitaitto, jonka muodostavat spesifiset aminohapot proteiinissa, joka sitoutuu sinkki-ioniin. Nämä proteiinit sitoutuvat usein DNA: han ja RNA: han, koska niiden muoto mahdollistaa domeenin läheisen vuorovaikutuksen DNA: n ja RNA: n nukleotidien kanssa. Niiden nukleotidia sitovat ominaisuudet mahdollistavat niiden toiminnan geeniekspression säätelyssä ja viruksen kokoonpanossa.
Sinkkisormirakenteita on useita tyyppejä, mutta yleisin versio koostuu alfa -heliksistä ja beeta -levystä, jotka ovat kaksi yleisintä proteiinien toissijaista rakennetta, vähintään yhden sinkki -ionin kummallakin puolella. Alfa -kierre ja beeta -arkki pysyvät paikallaan kystiini- ja histidiinitähteillä, jotka koordinoivat sinkki -ionia niiden typpi- ja rikkiatomien kautta. Sinkkisormi sitoutuu DNA: han ja sen kehällä olevien aminohappojen vuorovaikutuksen kautta emäsparien kanssa DNA -kaksoiskierukan keskellä. Se on kompakti proteiinidomeeni, ja sen pienen koon ansiosta se voi olla lähellä DNA -emäsparia.
Nämä proteiinit ovat yleisimpiä transkriptiotekijöitä elävissä organismeissa. Transkriptiotekijä on proteiini, joka sitoutuu DNA: han ja ohjaa geneettisen tiedon siirtoa RNA: han. Se tosiasia, että nämä proteiinit kohdistavat DNA: ta, ovat tehneet niistä ehdokkaita tarkoituksenmukaiseen uudelleensuunnitteluun kohdistaakseen kiinnostavat DNA-sekvenssit.
Esimerkiksi sinkkisorminukleaasi (ZFN) on synteettinen proteiini, jolla on suunniteltu sinkkisormen sitova domeeni, joka on fuusioitu restriktioendonukleaasiin tai DNA: ta pilkkovaan entsyymiin. ZFN: ää voidaan käyttää DNA: n leikkaamiseen tietyissä paikoissa, ja se on hyödyllinen työkalu edistämään DNA: n kohdespesifistä rekombinaatiota. Suunniteltuja sinkkisormia voidaan käyttää myös keinotekoisina transkriptiotekijöinä.
Sinkin sormen domeeneja löytyy joistakin virusproteiineista, mukaan lukien ihmisen immuunikatoviruksen (HIV-1) viruksen neokapsidi (NC) -proteiini. NC on houkutteleva antiviraalinen kohde, koska se on tärkeä viruksen kokoonpanolle ja on erittäin säilynyt. Viruksen replikaation estämiseksi voitaisiin käyttää estäjiä, jotka kohdistuvat erityisesti virus- ja retrovirusproteiinien sinkkisormiin. Tämän tyyppisten viruslääkkeiden hankkiminen on aktiivinen biolääketieteellisen tutkimuksen alue.
Näillä proteiineilla on tärkeä rooli solujen normaalissa aineenvaihdunnassa. Ollakseen tehokkaita retrovirusvastaisten yhdisteiden on kohdistettava erityisesti retrovirusinsinkkiproteiineihin. Näillä retrovirusproteiineilla on selvät aminohapposekvenssit ja rakenteelliset erot solun sinkkisormiproteiineista, joten selektiivisten estäjien saaminen on saavutettavissa oleva tavoite.