Sisäisen tarkastuksen ohjelmisto on tietokoneohjelma tai -sovellus, jonka avulla yritys voi tarkastella taloudellisia tietoja. Yhtiön kirjanpitäjät ovat tyypillisesti tämän ohjelman ensisijaisia käyttäjiä, vaikka yrityksen ylimmällä johdolla voi olla myös käyttöoikeus. Monien sisäisen tarkastuksen ohjelmistosovellusten avulla käyttäjät voivat seurata auditointeja, kerätä kenttätutkimuksen tekemiseen tarvittavia tietoja, tarkastella tietokonepohjaisia tarkastusreittejä, toteuttaa valvontatoimia ja tarkastuskäytäntöjä kansallisten tilinpäätösstandardien mukaisesti. Suuret organisaatiot palkkaavat usein useita kirjanpitäjiä, joiden yksinomainen vastuu on tarkastaa yrityksen taloudelliset tiedot.
Yritykset voivat tehdä sisäisiä tarkastuksia niin usein kuin haluavat. Julkisyhteisöillä voi olla vaatimuksia, jotka johtavat neljännesvuosittaisiin sisäisiin tarkastuksiin sisäisiltä tai ulkoisilta tarkastajilta. Sisäisen tarkastuksen ohjelmiston avulla yritykset voivat luoda digitaalisen tietueen jokaisesta tarkastuksesta. Yritykset voivat luetella henkilöt, joilla on pääsy tietoihin, sekä henkilöt, jotka ovat vastuussa tiettyjen tehtävien tai toimintojen suorittamisesta. Sisäisten tarkastajien on ehkä myös ladattava kenttätyöpaperinsa tai muut testatut kohteet ohjelmistoon, jotta ylempi johto voi tarkastella tarkastusasiakirjoja.
Jotkin sisäisen tarkastuksen ohjelmistot mahdollistavat myös tietojen sähköisen keräämisen. Kun tilintarkastajia käytetään yhdessä muiden ohjelmistojen kanssa, kuten kirjanpito, talous tai yleinen hallinto, he voivat luoda raportteja, joissa luetellaan tilintarkastajien tarkastamat taloudelliset tiedot. Integroidun tarkastusohjelmistojärjestelmän käyttäminen voi säästää paljon aikaa, koska tarkastajat voivat käyttää enemmän aikaa tosiasialliseen tietojen tarkasteluun kuin tarvittavien tietojen keräämiseen. Tämän tiedonkeruuprosessin aikana tarkastajat voivat myös tarkastella tietokonepohjaisia tarkastusjälkiä. Tämä polku raportoi kaikki käyttäjät, jotka ovat päässeet tietoihin ja tehneet muutoksia kirjanpitojärjestelmään, mikä on välttämätön osa tarkastusprosessia.
Kun yritykset käyttävät sisäistä tarkastusohjelmistoa, ne voivat asettaa sisäisen valvonnan, joka rajoittaa käyttäjien mahdollisuutta käyttää tai muuttaa tietoja. Useimpien yritysten on erotettava kirjanpitotehtävänsä useiden eri työntekijöiden kesken. Tietokonepohjaisen ohjelmistojärjestelmän avulla kirjanpidon johtajat ja esimiehet voivat rajoittaa moduulien tai toimintojen määrää, joita yksi henkilö voi suorittaa yrityksen ohjelmistojärjestelmässä. Tilintarkastajat testaavat usein näitä tietokonepohjaisia valvontatoimenpiteitä varmistaakseen, että yhtiö on erottanut kirjanpitotehtävät tarkasti.
Yritykset voivat myös pystyä sisällyttämään kirjanpito- tai tilintarkastusohjeet sisäisen tarkastuksen ohjelmistoon. Tämä mahdollistaa yrityksen kirjanpito -ohjeiden välittömän vertaamisen kansallisiin tilinpäätösstandardeihin. Säilyttämällä sähköisen kopion aiemmista sisäisistä tarkastuksista yhtiö voi myös määrittää, paraneeko vai huononeeko se mitenkään tai kirjanpidollisesti. Ulkoisilla tarkastajilla, joiden on tarkastettava nämä tiedot, voi olla myös pääsy ohjelmistoon virallisempia tarkastuksia varten.