Solunsisäinen pilkkominen on prosessi, jossa solut ottavat materiaaleja ja hajottavat ne solukalvon sisällä, toisin kuin solunulkoinen pilkkominen, jossa solut erittävät entsyymejä hajottamaan komponentteja soluseinän ulkopuolella. Esimerkkejä molemmista voidaan nähdä joissakin organismeissa. Tämän prosessin avulla yksittäiset solut voivat saada ravinteita ympäristöstään, murtaa uhat ja käsitellä omia jätteitään sekä tukea itseään nälän aikana.
Solunsisäisessä digestoinnissa solu kykenee imemään ulkopuolisen ympäristön materiaaleja. Yksisoluisille organismeille tämä tarjoaa menetelmän ravinnon saamiseksi solun ruokkimiseksi. Toinen solunsisäisen hajoamisen käyttö on immuunijärjestelmässä, jossa solut voivat imeä bakteereja, viruksia ja muita vieraita hiukkasia ja hajottaa ne neutraloimaan ne poistamalla mahdolliset tartuntalähteet.
Solunsisäistä hajoamista on kahdenlaisia. Heterofagiseen pilkkomiseen kuuluu solujen ulkopuolisten esineiden hajottaminen, kun taas autofagiseen solunsisäiseen pilkkomiseen liittyy komponenttien kuluttaminen solun sisältä. Tämä voi tapahtua, kun solu on nälkäinen, ja voi johtaa hajoamiseen, joka tunnetaan myös nimellä solukuolema, jos solu sulattaa liikaa itsestään etsiessään energiaa toimiakseen. Solut voidaan myös ohjelmoida tai laukaista aloittamaan itsesulatus, kun ne ovat vanhentuneet käyttökelpoisiksi tai kun ne ovat tartunnan saaneita taudinaiheuttajia.
Heterofagisessa ruoansulatuksessa, kun solu on imenyt kohteen, solun sisällä olevat rakenteet, joita kutsutaan lysosomeiksi, vapauttavat entsyymejä hajottaakseen kohteen. Entsyymit toimivat kuin leikkurit ja leikkaavat solun sisältämän kohteen keskeiset proteiinit. Riippuen siitä, mitä se on, se voidaan hajottaa käyttökelpoisiksi komponenteiksi, joita solu voi kierrättää, tai se voidaan leikata jätetuotteiksi poistettavaksi. Kun kyseessä on ruoansulatus, ravitsemuksellisesti, yleensä joitakin jätteitä syntyy matkan varrella ja ne voidaan viedä takaisin soluseinän läpi poistettavaksi.
Solunsisäinen hajoaminen tapahtuu kaikilla ravintoketjun tasoilla, sinivalaan soluista, jotka pyrkivät hajottamaan bakteerit, yksisoluisiin organismeihin maaperässä, jotka hajottavat elintarvikelähteet hyödyllisiksi komponenteiksi. Monisoluisilla eläimillä on myös ruoansulatuskanava solunulkoiselle ruoansulatukselle, jossa ruoka hajotetaan käyttökelpoisiksi komponenteiksi soluseinien ulkopuolella ruoansulatusmehujen avulla, ja nämä komponentit voivat siirtyä verenkiertoon jakautumaan koko kehoon. Ne kulkevat yksittäisten solujen soluseinien läpi antaakseen heille energiaa ja muita tarvittavia tarvikkeita selviytyäkseen.