Suojarahastojen kirjanpito on tärkeä osa mitä tahansa hedge -rahastoa, koska se on rahaston taloudellisen vastuun kulmakivi. Suojarahastojen kirjanpito on tapa, jolla yritys kokoaa kaikki rahastoa koskevat välityslausunnot. Kaikki, mihin rahasto sijoittaa, ja kaikkialla, missä rahasto päättää sijoittaa rahaa, on otettava huomioon hedge -rahastojen laskentataulukoissa. Tämä on paras tapa rahaston raportoida sijoittajille siitä, miten rahat kasvavat.
Suojarahastojen kirjanpitoa hoitaa tyypillisesti saman yrityksen ulkoistettu versio, joka hoitaa itse rahastoa. Kirjanpitäjät, jotka laativat kirjanpitoa, ovat erittäin erikoistuneita ja pitävät kirjaa kaikista salkunanalyyseistä. On ehdotettu, että hedge-rahastot pakotetaan palkkaamaan täysin erilliset hedge-rahastojen kirjanpitäjät ylläpitämään sekki- ja tasapainojärjestelmää, mutta se ei ole yleinen käytäntö.
Suojarahastojen kirjanpito määrittää myös suojausrahaston taukojaksot. Tällöin periaatteet ja kumppanit maksetaan rahaston vuoden aikana saamista varoista. Tällöin monet ihmiset sijoittavat voiton uudelleen rahastoon, jos se toimii hyvin. Jokaisen taukojakson voittoja voidaan muuttaa ja sijoittajat voivat halutessaan poistaa kaikki rahat hedge -rahastosta.
Suojarahastojen kirjanpito maksaa rahastolle 1 prosentin vuodessa. Tämä maksu vahvistettiin hallinnoimaan tämän palvelun kustannuksia rahaston mukaisesti. Laskutusmaksu erääntyy neljännesvuosittain, kuukauden ensimmäisenä päivänä tammikuussa, huhtikuussa, heinäkuussa ja lokakuussa.
Suojausrahastojen kirjanpidon tuotto tunnetaan substanssiarvona tai nettovarallisuutena. Sijoittajille on myös muita kirjanpitoraportteja, ja jotkut hedge -rahastot tarjoavat muita raportteja kuukausittain, mutta nettoarvo on toimitettava kerran vuodessa. NAV: n lisäksi rahaston tulisi toimittaa sijoittajille vuosittaiset tuloveroraportit, jotta sijoittaja voi ilmoittaa tulonsa asianmukaisesti Yhdysvaltain sisäiselle verovirastolle.
NAV -arvoa käytetään hedge -rahastojen tuottoennätyksen rakentamiseen. Nämä ovat tietueita, joita sijoittajat käyttävät päättäessään, mihin hedge -rahastoihin sijoitetaan. Siksi hedge -rahastojen kirjanpito on asetettu kyseenalaiseksi, kun NAV: n ja varsinaisen rahaston välillä on ollut epäjohdonmukaisuuksia. Tämä on lisännyt vaatimusta puolueettomasta kolmannen osapuolen kirjanpidosta, vaikka se todennäköisesti maksaa rahastolle enemmän pitkällä aikavälillä.