SYBR Green® on fluoresoiva väri, joka sitoutuu kaksijuosteiseen DNA: han erittäin spesifisesti. Sitä käytetään laajalti molekyylibiologian tutkimuksessa kaksijuosteisen DNA: n kvantifioimiseksi ja visualisoimiseksi. SYBR Green® on synteettinen väriaine, jonka esitteli Invitrogen & trade Corporationin tytäryhtiö Molecular Probes®, Inc. 1990 -luvun alussa. Se on epäsymmetrinen syaniiniväri, jonka syaniinit ovat synteettisten orgaanisten väriaineiden perhe, jota käytetään valokuvauksessa, CD-R- ja DVD-R-medioissa ja monissa molekyylibiologian tutkimussovelluksissa.
Useat ominaisuudet tekevät SYBR Greenistä erityisen hyödyllisen nukleiinihappovärinä. Se on vakaa eri lämpötiloissa, joten sitä voidaan käyttää korkeiden ja matalien lämpötilojen biokemiallisten reaktioiden seuraamiseen. Se sitoutuu ei-kovalenttisesti DNA: n pintaan, mikä tarkoittaa, että se ei häiritse useimpien nukleaasien ja DNA-polymeraasien toimintaa. Se sitoutuu myös nukleiinihappoihin dynaamisella lineaarisella alueella, joka on jopa neljä suuruusluokkaa, joten se voi antaa tarkan kvantifioinnin DNA: sta laajalla pitoisuusalueella.
SYBR Greenin® yleisimpiä laboratoriokäyttöjä ovat kaksijuosteisen DNA: n havaitseminen reaaliaikaisessa polymeraasiketjureaktiossa (PCR) ja akryyliamidigeeleissä. PCR on tekniikka, jolla monistetaan muutama DNA -kopio toistuvilla DNA -replikaatiosyklillä. Reaaliaikainen PCR mittaa monistuksen sen tapahtuessa, ja koska SYBR Green® sitoutuu kaksijuosteiseen DNA: han, mitattaessa DNA-väriainekompleksin fluoresenssipäästöt tutkija voi mitata tuotettavan DNA: n määrän. PCR -syklien edetessä fluoresenssi kasvaa suhteessa tuotetun PCR -tuotteen määrään.
Akryyliamidigeelit ovat kaikkialla läsnä molekyylibiologian laboratorioissa, koska ne palvelevat yleisesti tarvittavaa tarkoitusta erottaa DNA -fragmentit koon mukaan. SYBR Green® antaa tutkijalle mahdollisuuden visualisoida DNA: ta akryyliamidigeelissä loistamalla siihen sopivan aallonpituuden valoa. Muita SYBR Greenin® käyttötarkoituksia ovat nukleiinihappojen havaitseminen liuoksessa, biosiru -sovelluksissa ja virtaussytometriassa. DNA-väriainekompleksi absorboi sinistä valoa aallonpituudella 488 nm ja säteilee vihreää valoa aallonpituudella 522 nm.
SYBR Green® on erittäin herkkä; se on 25 kertaa herkempi kuin etidiumbromidi, toinen yleisesti käytetty väri DNA: n visualisoimiseksi. SYBR Green®: n suuri affiniteetti kaksijuosteiseen DNA: han tekee siitä hyödyllisen pienen kopioluvun DNA -näytteiden havaitsemiseksi. Se sitoo ensisijaisesti kaksijuosteista DNA: ta, mutta se voi myös sitoa yksijuosteisen DNA: n vähentyneellä fluoresenssilla. Kuten kaikki DNA: ta sitovat molekyylit, SYBR Green® voi aiheuttaa mutaatioita ja on mahdollinen karsinogeeni. On kuitenkin turvallisempaa työskennellä ja helpompi hävittää kuin etidiumbromidi.