Tarkastuksen tavoitteiden tarkoituksena on luoda puitteet itse tarkastukselle. Antamalla parametrit tarkastajat tietävät tarkat tavoitteensa. Tilintarkastajilla on moraalinen velvollisuus tehdä parasta mahdollista työtä ja löytää totuus. Yhtiö määrittelee, mitä tutkitaan, mutta tilintarkastajat päättävät, mikä on tavoite ja mikä ei.
Tarkastuksia koskevat kansalliset lait vaihtelevat maittain. Lait vaihtelevat myös yrityksen tyypin mukaan. Esimerkiksi Amerikassa pörssissä oleviin yrityksiin sovelletaan tiukempia tilintarkastuslakeja sen varmistamiseksi, että sijoittajat saavat todellista arvoa.
Tarkastuksia sovelletaan kokonaisiin yrityksiin tai tiettyihin yrityksen osiin. Nämä tehdään joko säännöllisesti tai erikseen pyydettäessä. Yleisillä sisäisillä tarkastuksilla on laajat tavoitteet, jotka kattavat kaikki tutkittavan liiketoiminnan tekijät. Tarkemmat tarkastukset räätälöivät tavoitteensa sen mukaan, mitä yritys haluaa opiskella.
Kaikki tarkastuksen tavoitteet on jaettu kahteen osaan. Ensinnäkin tarkastus asettaa tarkastuksessa tavoitteet puitteiden luomiseksi. Toiseksi tarkastuksessa asetetaan tavoitteita omien rajoitustensa riskin vähentämiseksi.
Peruskaupan tarkastus kattaa varastot, henkilöstöresurssit ja myynnin. Tilintarkastajan on luetteloitava myymälän varastot, tarkistettava sen myyntitiedot ja tasapainotettava ne myymälään tulevien varastojen kanssa. Tavoitteena on päättää, ovatko luvut yhtäpitäviä, ja löytää eroja. Tarkastustavoitteiden tarkoituksena on auttaa parantamaan myymälän prosesseja ja parantamaan turvallisuutta.
Suurempien yritysten sisäiset tarkastukset jakavat tarkastuksensa viiteen osaan. Kunkin osion tarkastustavoitteina on testata yrityksen valvontaa ja sen menettelytapoja. Tämä tehdään tutkimalla kaikki sen paperityöt ja varastot. Tällaiset työpaikat vaativat suuria tilintarkastusyrityksiä. Vaikka yksi tilintarkastaja voi tarkastaa yksinkertaisen myymälän, suuret yritykset tarvitsevat kokonaisia tiimejä.
Sisäisen tarkastuksen ensimmäinen osa koskee yrityksen taloutta ja toimintaa koskevia tietoja. Toisessa tarkastellaan sen politiikkoja ja suunnitelmia verrattuna kansallisiin ja paikallisiin lakeihin ja määräyksiin. Kolmannessa tarkastellaan turvallisuusmenetelmiä ja sitä, miten yritys suojaa omaisuuttaan. Neljäs koskee yrityksen resurssien käyttöä. Viimeisessä osassa tarkastellaan liiketoiminnan tavoitteita.
Toinen osa on hyvä esimerkki siitä, missä tilintarkastuksen tavoitteet ja yrityksen tavoitteet voivat poiketa toisistaan. Yhtiö haluaa työntekijöidensä noudattavan menettelyjään ja prosessejaan. Tilintarkastaja puolestaan vertaa niitä myös kaikkiin niihin liittyviin lakeihin ja määräyksiin. Tarkastuksen tavoitteiden tarkoituksena on varmistaa, että yhtiö on laillinen.